Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB1

Acss1, Acetyl-coenzyme A synthetase 2-like, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acss1Q99NB1 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Acss1Q99NB1 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Acss1Q99NB1 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Acss1Q99NB1 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Acss1Q99NB1 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Acss1Q99NB1 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Acss1Q99NB1 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Acss1Q99NB1 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Acss1Q99NB1 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Acss1Q99NB1 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Acss1Q99NB1 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Acss1Q99NB1 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Acss1Q99NB1 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Acss1Q99NB1 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Acss1Q99NB1 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Acss1Q99NB1 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Acss1Q99NB1 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Acss1Q99NB1 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Acss1Q99NB1 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Acss1Q99NB1 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Acss1Q99NB1 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Acss1Q99NB1 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Acss1Q99NB1 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Acss1Q99NB1 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Acss1Q99NB1 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Acss1Q99NB1 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Acss1Q99NB1 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Acss1Q99NB1 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Acss1Q99NB1 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Acss1Q99NB1 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Acss1Q99NB1 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Acss1Q99NB1 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Acss1Q99NB1 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Acss1Q99NB1 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Acss1Q99NB1 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Acss1Q99NB1 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Acss1Q99NB1 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Acss1Q99NB1 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Acss1Q99NB1 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Acss1Q99NB1 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Acss1Q99NB1 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Acss1Q99NB1 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Acss1Q99NB1 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Acss1Q99NB1 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Acss1Q99NB1 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Acss1Q99NB1 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Acss1Q99NB1 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Acss1Q99NB1 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Acss1Q99NB1 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Acss1Q99NB1 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Acss1Q99NB1 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Acss1Q99NB1 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Acss1Q99NB1 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Acss1Q99NB1 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Acss1Q99NB1 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Acss1Q99NB1 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Acss1Q99NB1 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Acss1Q99NB1 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Acss1Q99NB1 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Acss1Q99NB1 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Acss1Q99NB1 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Acss1Q99NB1 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Acss1Q99NB1 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Acss1Q99NB1 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Acss1Q99NB1 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Acss1Q99NB1 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Acss1Q99NB1 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Acss1Q99NB1 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Acss1Q99NB1 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Acss1Q99NB1 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Acss1Q99NB1 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Acss1Q99NB1 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Acss1Q99NB1 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Acss1Q99NB1 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Acss1Q99NB1 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Acss1Q99NB1 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Acss1Q99NB1 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Acss1Q99NB1 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Acss1Q99NB1 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Acss1Q99NB1 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Acss1Q99NB1 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Acss1Q99NB1 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Acss1Q99NB1 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Acss1Q99NB1 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Acss1Q99NB1 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Acss1Q99NB1 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Acss1Q99NB1 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Acss1Q99NB1 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Acss1Q99NB1 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Acss1Q99NB1 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Acss1Q99NB1 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Acss1Q99NB1 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Acss1Q99NB1 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Acss1Q99NB1 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Acss1Q99NB1 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Acss1Q99NB1 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Acss1Q99NB1 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Acss1Q99NB1 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Acss1Q99NB1 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Acss1Q99NB1 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms