Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA2

Atoh8, Protein atonal homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atoh8Q99NA2 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atoh8Q99NA2 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atoh8Q99NA2 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atoh8Q99NA2 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atoh8Q99NA2 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atoh8Q99NA2 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atoh8Q99NA2 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atoh8Q99NA2 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atoh8Q99NA2 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atoh8Q99NA2 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atoh8Q99NA2 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atoh8Q99NA2 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atoh8Q99NA2 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atoh8Q99NA2 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atoh8Q99NA2 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atoh8Q99NA2 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atoh8Q99NA2 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atoh8Q99NA2 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Atoh8Q99NA2 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atoh8Q99NA2 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atoh8Q99NA2 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atoh8Q99NA2 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Atoh8Q99NA2 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atoh8Q99NA2 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atoh8Q99NA2 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atoh8Q99NA2 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atoh8Q99NA2 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atoh8Q99NA2 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atoh8Q99NA2 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atoh8Q99NA2 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atoh8Q99NA2 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atoh8Q99NA2 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atoh8Q99NA2 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atoh8Q99NA2 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atoh8Q99NA2 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atoh8Q99NA2 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atoh8Q99NA2 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atoh8Q99NA2 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atoh8Q99NA2 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atoh8Q99NA2 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atoh8Q99NA2 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atoh8Q99NA2 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atoh8Q99NA2 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atoh8Q99NA2 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atoh8Q99NA2 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atoh8Q99NA2 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atoh8Q99NA2 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Atoh8Q99NA2 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Atoh8Q99NA2 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Atoh8Q99NA2 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atoh8Q99NA2 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atoh8Q99NA2 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atoh8Q99NA2 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atoh8Q99NA2 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atoh8Q99NA2 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atoh8Q99NA2 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atoh8Q99NA2 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atoh8Q99NA2 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atoh8Q99NA2 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atoh8Q99NA2 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atoh8Q99NA2 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Atoh8Q99NA2 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atoh8Q99NA2 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atoh8Q99NA2 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atoh8Q99NA2 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atoh8Q99NA2 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atoh8Q99NA2 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atoh8Q99NA2 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atoh8Q99NA2 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atoh8Q99NA2 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atoh8Q99NA2 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atoh8Q99NA2 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Atoh8Q99NA2 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atoh8Q99NA2 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atoh8Q99NA2 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atoh8Q99NA2 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atoh8Q99NA2 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atoh8Q99NA2 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atoh8Q99NA2 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atoh8Q99NA2 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atoh8Q99NA2 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atoh8Q99NA2 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atoh8Q99NA2 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atoh8Q99NA2 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atoh8Q99NA2 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atoh8Q99NA2 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atoh8Q99NA2 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atoh8Q99NA2 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atoh8Q99NA2 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atoh8Q99NA2 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atoh8Q99NA2 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atoh8Q99NA2 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atoh8Q99NA2 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atoh8Q99NA2 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atoh8Q99NA2 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Atoh8Q99NA2 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atoh8Q99NA2 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atoh8Q99NA2 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atoh8Q99NA2 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atoh8Q99NA2 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms