Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ7

Rcbtb2, RCC1 and BTB domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb2Q99LJ7 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rcbtb2Q99LJ7 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rcbtb2Q99LJ7 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rcbtb2Q99LJ7 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rcbtb2Q99LJ7 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rcbtb2Q99LJ7 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rcbtb2Q99LJ7 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rcbtb2Q99LJ7 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rcbtb2Q99LJ7 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms