Protein–RNA interactions for Protein: Q99LF4

Rtcb, tRNA-splicing ligase RtcB homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RtcbQ99LF4 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RtcbQ99LF4 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RtcbQ99LF4 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RtcbQ99LF4 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RtcbQ99LF4 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RtcbQ99LF4 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RtcbQ99LF4 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RtcbQ99LF4 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RtcbQ99LF4 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RtcbQ99LF4 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RtcbQ99LF4 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RtcbQ99LF4 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RtcbQ99LF4 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RtcbQ99LF4 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RtcbQ99LF4 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RtcbQ99LF4 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RtcbQ99LF4 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RtcbQ99LF4 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RtcbQ99LF4 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RtcbQ99LF4 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RtcbQ99LF4 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RtcbQ99LF4 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RtcbQ99LF4 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RtcbQ99LF4 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RtcbQ99LF4 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RtcbQ99LF4 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RtcbQ99LF4 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RtcbQ99LF4 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RtcbQ99LF4 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RtcbQ99LF4 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RtcbQ99LF4 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RtcbQ99LF4 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RtcbQ99LF4 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RtcbQ99LF4 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RtcbQ99LF4 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RtcbQ99LF4 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RtcbQ99LF4 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RtcbQ99LF4 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RtcbQ99LF4 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RtcbQ99LF4 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RtcbQ99LF4 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RtcbQ99LF4 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RtcbQ99LF4 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RtcbQ99LF4 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
RtcbQ99LF4 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
RtcbQ99LF4 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
RtcbQ99LF4 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
RtcbQ99LF4 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RtcbQ99LF4 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RtcbQ99LF4 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RtcbQ99LF4 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RtcbQ99LF4 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RtcbQ99LF4 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RtcbQ99LF4 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RtcbQ99LF4 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RtcbQ99LF4 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RtcbQ99LF4 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RtcbQ99LF4 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RtcbQ99LF4 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RtcbQ99LF4 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RtcbQ99LF4 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RtcbQ99LF4 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RtcbQ99LF4 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RtcbQ99LF4 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RtcbQ99LF4 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RtcbQ99LF4 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RtcbQ99LF4 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RtcbQ99LF4 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RtcbQ99LF4 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RtcbQ99LF4 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RtcbQ99LF4 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RtcbQ99LF4 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RtcbQ99LF4 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RtcbQ99LF4 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RtcbQ99LF4 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RtcbQ99LF4 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RtcbQ99LF4 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RtcbQ99LF4 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RtcbQ99LF4 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RtcbQ99LF4 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RtcbQ99LF4 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RtcbQ99LF4 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RtcbQ99LF4 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RtcbQ99LF4 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RtcbQ99LF4 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RtcbQ99LF4 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RtcbQ99LF4 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RtcbQ99LF4 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RtcbQ99LF4 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RtcbQ99LF4 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RtcbQ99LF4 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RtcbQ99LF4 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RtcbQ99LF4 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RtcbQ99LF4 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RtcbQ99LF4 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RtcbQ99LF4 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RtcbQ99LF4 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RtcbQ99LF4 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RtcbQ99LF4 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RtcbQ99LF4 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms