Protein–RNA interactions for Protein: Q99L48

Nmd3, 60S ribosomal export protein NMD3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nmd3Q99L48 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nmd3Q99L48 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nmd3Q99L48 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nmd3Q99L48 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nmd3Q99L48 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nmd3Q99L48 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nmd3Q99L48 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nmd3Q99L48 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nmd3Q99L48 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nmd3Q99L48 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nmd3Q99L48 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nmd3Q99L48 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nmd3Q99L48 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nmd3Q99L48 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nmd3Q99L48 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nmd3Q99L48 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nmd3Q99L48 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nmd3Q99L48 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nmd3Q99L48 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nmd3Q99L48 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nmd3Q99L48 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nmd3Q99L48 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nmd3Q99L48 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nmd3Q99L48 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nmd3Q99L48 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nmd3Q99L48 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nmd3Q99L48 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Nmd3Q99L48 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nmd3Q99L48 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nmd3Q99L48 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nmd3Q99L48 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nmd3Q99L48 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nmd3Q99L48 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nmd3Q99L48 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nmd3Q99L48 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nmd3Q99L48 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nmd3Q99L48 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nmd3Q99L48 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nmd3Q99L48 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nmd3Q99L48 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nmd3Q99L48 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nmd3Q99L48 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nmd3Q99L48 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nmd3Q99L48 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nmd3Q99L48 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nmd3Q99L48 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nmd3Q99L48 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nmd3Q99L48 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nmd3Q99L48 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nmd3Q99L48 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nmd3Q99L48 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nmd3Q99L48 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nmd3Q99L48 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nmd3Q99L48 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nmd3Q99L48 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nmd3Q99L48 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nmd3Q99L48 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nmd3Q99L48 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nmd3Q99L48 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nmd3Q99L48 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nmd3Q99L48 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nmd3Q99L48 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nmd3Q99L48 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nmd3Q99L48 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nmd3Q99L48 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nmd3Q99L48 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Nmd3Q99L48 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nmd3Q99L48 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Nmd3Q99L48 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nmd3Q99L48 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nmd3Q99L48 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nmd3Q99L48 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nmd3Q99L48 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nmd3Q99L48 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nmd3Q99L48 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Nmd3Q99L48 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Nmd3Q99L48 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nmd3Q99L48 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nmd3Q99L48 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nmd3Q99L48 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nmd3Q99L48 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nmd3Q99L48 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nmd3Q99L48 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nmd3Q99L48 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nmd3Q99L48 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nmd3Q99L48 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nmd3Q99L48 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Nmd3Q99L48 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nmd3Q99L48 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nmd3Q99L48 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nmd3Q99L48 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nmd3Q99L48 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nmd3Q99L48 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nmd3Q99L48 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nmd3Q99L48 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nmd3Q99L48 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nmd3Q99L48 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Nmd3Q99L48 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Nmd3Q99L48 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Nmd3Q99L48 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms