Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ciao1Q99KN2 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Ciao1Q99KN2 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ciao1Q99KN2 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ciao1Q99KN2 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Ciao1Q99KN2 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ciao1Q99KN2 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ciao1Q99KN2 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ciao1Q99KN2 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ciao1Q99KN2 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ciao1Q99KN2 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ciao1Q99KN2 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ciao1Q99KN2 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ciao1Q99KN2 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ciao1Q99KN2 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ciao1Q99KN2 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ciao1Q99KN2 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ciao1Q99KN2 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ciao1Q99KN2 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ciao1Q99KN2 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ciao1Q99KN2 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Ciao1Q99KN2 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Ciao1Q99KN2 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Ciao1Q99KN2 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ciao1Q99KN2 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ciao1Q99KN2 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ciao1Q99KN2 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ciao1Q99KN2 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ciao1Q99KN2 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ciao1Q99KN2 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ciao1Q99KN2 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ciao1Q99KN2 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ciao1Q99KN2 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ciao1Q99KN2 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ciao1Q99KN2 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ciao1Q99KN2 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ciao1Q99KN2 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ciao1Q99KN2 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Ciao1Q99KN2 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ciao1Q99KN2 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ciao1Q99KN2 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Ciao1Q99KN2 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ciao1Q99KN2 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ciao1Q99KN2 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ciao1Q99KN2 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ciao1Q99KN2 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ciao1Q99KN2 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ciao1Q99KN2 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ciao1Q99KN2 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ciao1Q99KN2 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ciao1Q99KN2 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ciao1Q99KN2 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Ciao1Q99KN2 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ciao1Q99KN2 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ciao1Q99KN2 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ciao1Q99KN2 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ciao1Q99KN2 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ciao1Q99KN2 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Ciao1Q99KN2 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ciao1Q99KN2 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ciao1Q99KN2 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ciao1Q99KN2 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ciao1Q99KN2 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ciao1Q99KN2 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ciao1Q99KN2 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Ciao1Q99KN2 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ciao1Q99KN2 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ciao1Q99KN2 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ciao1Q99KN2 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Ciao1Q99KN2 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ciao1Q99KN2 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ciao1Q99KN2 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ciao1Q99KN2 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ciao1Q99KN2 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ciao1Q99KN2 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ciao1Q99KN2 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ciao1Q99KN2 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ciao1Q99KN2 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ciao1Q99KN2 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ciao1Q99KN2 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ciao1Q99KN2 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ciao1Q99KN2 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ciao1Q99KN2 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ciao1Q99KN2 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ciao1Q99KN2 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ciao1Q99KN2 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ciao1Q99KN2 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ciao1Q99KN2 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ciao1Q99KN2 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ciao1Q99KN2 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ciao1Q99KN2 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ciao1Q99KN2 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ciao1Q99KN2 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ciao1Q99KN2 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ciao1Q99KN2 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ciao1Q99KN2 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ciao1Q99KN2 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ciao1Q99KN2 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ciao1Q99KN2 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ciao1Q99KN2 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms