Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG7

Hps4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps4Q99KG7 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hps4Q99KG7 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hps4Q99KG7 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hps4Q99KG7 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hps4Q99KG7 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Hps4Q99KG7 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hps4Q99KG7 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hps4Q99KG7 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hps4Q99KG7 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hps4Q99KG7 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hps4Q99KG7 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hps4Q99KG7 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hps4Q99KG7 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hps4Q99KG7 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hps4Q99KG7 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hps4Q99KG7 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hps4Q99KG7 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hps4Q99KG7 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hps4Q99KG7 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Hps4Q99KG7 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Hps4Q99KG7 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Hps4Q99KG7 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Hps4Q99KG7 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Hps4Q99KG7 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Hps4Q99KG7 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Hps4Q99KG7 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Hps4Q99KG7 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hps4Q99KG7 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hps4Q99KG7 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hps4Q99KG7 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hps4Q99KG7 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hps4Q99KG7 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hps4Q99KG7 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hps4Q99KG7 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hps4Q99KG7 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hps4Q99KG7 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hps4Q99KG7 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hps4Q99KG7 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hps4Q99KG7 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Hps4Q99KG7 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hps4Q99KG7 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Hps4Q99KG7 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hps4Q99KG7 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hps4Q99KG7 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hps4Q99KG7 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hps4Q99KG7 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hps4Q99KG7 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hps4Q99KG7 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hps4Q99KG7 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hps4Q99KG7 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hps4Q99KG7 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hps4Q99KG7 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hps4Q99KG7 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hps4Q99KG7 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hps4Q99KG7 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hps4Q99KG7 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hps4Q99KG7 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hps4Q99KG7 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hps4Q99KG7 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hps4Q99KG7 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hps4Q99KG7 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hps4Q99KG7 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hps4Q99KG7 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hps4Q99KG7 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hps4Q99KG7 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hps4Q99KG7 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Hps4Q99KG7 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hps4Q99KG7 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hps4Q99KG7 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hps4Q99KG7 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hps4Q99KG7 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hps4Q99KG7 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hps4Q99KG7 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hps4Q99KG7 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hps4Q99KG7 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hps4Q99KG7 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hps4Q99KG7 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hps4Q99KG7 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hps4Q99KG7 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hps4Q99KG7 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hps4Q99KG7 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hps4Q99KG7 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hps4Q99KG7 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hps4Q99KG7 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hps4Q99KG7 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hps4Q99KG7 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hps4Q99KG7 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hps4Q99KG7 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hps4Q99KG7 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Hps4Q99KG7 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hps4Q99KG7 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hps4Q99KG7 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hps4Q99KG7 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hps4Q99KG7 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hps4Q99KG7 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hps4Q99KG7 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hps4Q99KG7 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hps4Q99KG7 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hps4Q99KG7 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Hps4Q99KG7 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms