Protein–RNA interactions for Protein: Q99JR1

Sfxn1, Sideroflexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfxn1Q99JR1 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sfxn1Q99JR1 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sfxn1Q99JR1 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sfxn1Q99JR1 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sfxn1Q99JR1 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sfxn1Q99JR1 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sfxn1Q99JR1 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sfxn1Q99JR1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sfxn1Q99JR1 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sfxn1Q99JR1 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sfxn1Q99JR1 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sfxn1Q99JR1 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sfxn1Q99JR1 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sfxn1Q99JR1 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sfxn1Q99JR1 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sfxn1Q99JR1 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sfxn1Q99JR1 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sfxn1Q99JR1 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sfxn1Q99JR1 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sfxn1Q99JR1 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Sfxn1Q99JR1 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Sfxn1Q99JR1 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sfxn1Q99JR1 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sfxn1Q99JR1 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sfxn1Q99JR1 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sfxn1Q99JR1 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sfxn1Q99JR1 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Sfxn1Q99JR1 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sfxn1Q99JR1 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sfxn1Q99JR1 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sfxn1Q99JR1 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Sfxn1Q99JR1 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sfxn1Q99JR1 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sfxn1Q99JR1 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sfxn1Q99JR1 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sfxn1Q99JR1 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sfxn1Q99JR1 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sfxn1Q99JR1 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sfxn1Q99JR1 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sfxn1Q99JR1 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sfxn1Q99JR1 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sfxn1Q99JR1 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sfxn1Q99JR1 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sfxn1Q99JR1 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sfxn1Q99JR1 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sfxn1Q99JR1 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Sfxn1Q99JR1 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sfxn1Q99JR1 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sfxn1Q99JR1 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sfxn1Q99JR1 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sfxn1Q99JR1 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sfxn1Q99JR1 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sfxn1Q99JR1 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sfxn1Q99JR1 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sfxn1Q99JR1 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sfxn1Q99JR1 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sfxn1Q99JR1 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sfxn1Q99JR1 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sfxn1Q99JR1 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sfxn1Q99JR1 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sfxn1Q99JR1 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Sfxn1Q99JR1 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sfxn1Q99JR1 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sfxn1Q99JR1 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sfxn1Q99JR1 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sfxn1Q99JR1 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sfxn1Q99JR1 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sfxn1Q99JR1 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sfxn1Q99JR1 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sfxn1Q99JR1 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sfxn1Q99JR1 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sfxn1Q99JR1 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sfxn1Q99JR1 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sfxn1Q99JR1 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sfxn1Q99JR1 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sfxn1Q99JR1 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sfxn1Q99JR1 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sfxn1Q99JR1 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sfxn1Q99JR1 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sfxn1Q99JR1 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sfxn1Q99JR1 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sfxn1Q99JR1 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sfxn1Q99JR1 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sfxn1Q99JR1 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sfxn1Q99JR1 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Sfxn1Q99JR1 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sfxn1Q99JR1 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sfxn1Q99JR1 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sfxn1Q99JR1 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Sfxn1Q99JR1 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sfxn1Q99JR1 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sfxn1Q99JR1 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sfxn1Q99JR1 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sfxn1Q99JR1 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sfxn1Q99JR1 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sfxn1Q99JR1 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sfxn1Q99JR1 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Sfxn1Q99JR1 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sfxn1Q99JR1 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sfxn1Q99JR1 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms