Protein–RNA interactions for Protein: Q99JL1

Spef1, Sperm flagellar protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spef1Q99JL1 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spef1Q99JL1 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spef1Q99JL1 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spef1Q99JL1 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spef1Q99JL1 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spef1Q99JL1 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spef1Q99JL1 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Spef1Q99JL1 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spef1Q99JL1 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spef1Q99JL1 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spef1Q99JL1 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spef1Q99JL1 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spef1Q99JL1 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spef1Q99JL1 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spef1Q99JL1 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spef1Q99JL1 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spef1Q99JL1 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Spef1Q99JL1 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spef1Q99JL1 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spef1Q99JL1 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spef1Q99JL1 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spef1Q99JL1 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Spef1Q99JL1 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spef1Q99JL1 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spef1Q99JL1 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spef1Q99JL1 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spef1Q99JL1 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spef1Q99JL1 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spef1Q99JL1 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spef1Q99JL1 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spef1Q99JL1 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spef1Q99JL1 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spef1Q99JL1 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spef1Q99JL1 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spef1Q99JL1 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spef1Q99JL1 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spef1Q99JL1 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spef1Q99JL1 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spef1Q99JL1 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Spef1Q99JL1 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spef1Q99JL1 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spef1Q99JL1 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spef1Q99JL1 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spef1Q99JL1 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spef1Q99JL1 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spef1Q99JL1 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spef1Q99JL1 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spef1Q99JL1 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spef1Q99JL1 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spef1Q99JL1 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spef1Q99JL1 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spef1Q99JL1 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spef1Q99JL1 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spef1Q99JL1 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spef1Q99JL1 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spef1Q99JL1 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spef1Q99JL1 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spef1Q99JL1 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spef1Q99JL1 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spef1Q99JL1 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spef1Q99JL1 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spef1Q99JL1 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spef1Q99JL1 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spef1Q99JL1 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spef1Q99JL1 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spef1Q99JL1 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spef1Q99JL1 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spef1Q99JL1 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spef1Q99JL1 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spef1Q99JL1 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spef1Q99JL1 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spef1Q99JL1 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spef1Q99JL1 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spef1Q99JL1 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spef1Q99JL1 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spef1Q99JL1 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spef1Q99JL1 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spef1Q99JL1 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spef1Q99JL1 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spef1Q99JL1 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spef1Q99JL1 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Spef1Q99JL1 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Spef1Q99JL1 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spef1Q99JL1 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spef1Q99JL1 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spef1Q99JL1 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spef1Q99JL1 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spef1Q99JL1 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spef1Q99JL1 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spef1Q99JL1 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spef1Q99JL1 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spef1Q99JL1 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spef1Q99JL1 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spef1Q99JL1 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spef1Q99JL1 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spef1Q99JL1 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spef1Q99JL1 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Spef1Q99JL1 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spef1Q99JL1 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spef1Q99JL1 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms