Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ddb2Q99J79 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddb2Q99J79 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddb2Q99J79 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Ddb2Q99J79 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ddb2Q99J79 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ddb2Q99J79 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Ddb2Q99J79 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ddb2Q99J79 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ddb2Q99J79 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Ddb2Q99J79 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Ddb2Q99J79 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ddb2Q99J79 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ddb2Q99J79 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ddb2Q99J79 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ddb2Q99J79 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ddb2Q99J79 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ddb2Q99J79 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ddb2Q99J79 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ddb2Q99J79 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ddb2Q99J79 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Ddb2Q99J79 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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