Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smim11aQ99J19 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smim11aQ99J19 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smim11aQ99J19 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smim11aQ99J19 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smim11aQ99J19 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smim11aQ99J19 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smim11aQ99J19 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smim11aQ99J19 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Smim11aQ99J19 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smim11aQ99J19 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smim11aQ99J19 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smim11aQ99J19 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smim11aQ99J19 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smim11aQ99J19 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smim11aQ99J19 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smim11aQ99J19 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smim11aQ99J19 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smim11aQ99J19 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smim11aQ99J19 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smim11aQ99J19 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smim11aQ99J19 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smim11aQ99J19 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smim11aQ99J19 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smim11aQ99J19 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smim11aQ99J19 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smim11aQ99J19 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smim11aQ99J19 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smim11aQ99J19 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smim11aQ99J19 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smim11aQ99J19 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smim11aQ99J19 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Smim11aQ99J19 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Smim11aQ99J19 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Smim11aQ99J19 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Smim11aQ99J19 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Smim11aQ99J19 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Smim11aQ99J19 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Smim11aQ99J19 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Smim11aQ99J19 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Smim11aQ99J19 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Smim11aQ99J19 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Smim11aQ99J19 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Smim11aQ99J19 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Smim11aQ99J19 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Smim11aQ99J19 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Smim11aQ99J19 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Smim11aQ99J19 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Smim11aQ99J19 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Smim11aQ99J19 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Smim11aQ99J19 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Smim11aQ99J19 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Smim11aQ99J19 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smim11aQ99J19 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smim11aQ99J19 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smim11aQ99J19 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smim11aQ99J19 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smim11aQ99J19 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smim11aQ99J19 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smim11aQ99J19 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smim11aQ99J19 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smim11aQ99J19 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smim11aQ99J19 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smim11aQ99J19 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smim11aQ99J19 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smim11aQ99J19 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smim11aQ99J19 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smim11aQ99J19 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smim11aQ99J19 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smim11aQ99J19 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smim11aQ99J19 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smim11aQ99J19 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smim11aQ99J19 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smim11aQ99J19 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smim11aQ99J19 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Smim11aQ99J19 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smim11aQ99J19 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smim11aQ99J19 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Smim11aQ99J19 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smim11aQ99J19 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smim11aQ99J19 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smim11aQ99J19 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smim11aQ99J19 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smim11aQ99J19 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smim11aQ99J19 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smim11aQ99J19 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smim11aQ99J19 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smim11aQ99J19 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smim11aQ99J19 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smim11aQ99J19 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smim11aQ99J19 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smim11aQ99J19 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smim11aQ99J19 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smim11aQ99J19 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smim11aQ99J19 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smim11aQ99J19 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smim11aQ99J19 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smim11aQ99J19 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smim11aQ99J19 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smim11aQ99J19 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms