Protein–RNA interactions for Protein: Q924D0

Rtn4ip1, Reticulon-4-interacting protein 1, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtn4ip1Q924D0 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtn4ip1Q924D0 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtn4ip1Q924D0 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtn4ip1Q924D0 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtn4ip1Q924D0 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtn4ip1Q924D0 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtn4ip1Q924D0 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtn4ip1Q924D0 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtn4ip1Q924D0 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtn4ip1Q924D0 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtn4ip1Q924D0 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtn4ip1Q924D0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtn4ip1Q924D0 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtn4ip1Q924D0 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtn4ip1Q924D0 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtn4ip1Q924D0 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtn4ip1Q924D0 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtn4ip1Q924D0 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtn4ip1Q924D0 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtn4ip1Q924D0 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtn4ip1Q924D0 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtn4ip1Q924D0 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtn4ip1Q924D0 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtn4ip1Q924D0 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtn4ip1Q924D0 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtn4ip1Q924D0 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtn4ip1Q924D0 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtn4ip1Q924D0 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtn4ip1Q924D0 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtn4ip1Q924D0 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtn4ip1Q924D0 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtn4ip1Q924D0 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtn4ip1Q924D0 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtn4ip1Q924D0 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtn4ip1Q924D0 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtn4ip1Q924D0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtn4ip1Q924D0 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtn4ip1Q924D0 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtn4ip1Q924D0 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtn4ip1Q924D0 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtn4ip1Q924D0 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtn4ip1Q924D0 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtn4ip1Q924D0 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtn4ip1Q924D0 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtn4ip1Q924D0 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtn4ip1Q924D0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtn4ip1Q924D0 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtn4ip1Q924D0 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtn4ip1Q924D0 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtn4ip1Q924D0 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtn4ip1Q924D0 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtn4ip1Q924D0 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtn4ip1Q924D0 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtn4ip1Q924D0 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtn4ip1Q924D0 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtn4ip1Q924D0 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtn4ip1Q924D0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtn4ip1Q924D0 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtn4ip1Q924D0 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtn4ip1Q924D0 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtn4ip1Q924D0 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtn4ip1Q924D0 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtn4ip1Q924D0 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtn4ip1Q924D0 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtn4ip1Q924D0 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtn4ip1Q924D0 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtn4ip1Q924D0 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtn4ip1Q924D0 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtn4ip1Q924D0 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtn4ip1Q924D0 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtn4ip1Q924D0 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtn4ip1Q924D0 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtn4ip1Q924D0 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtn4ip1Q924D0 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtn4ip1Q924D0 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtn4ip1Q924D0 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtn4ip1Q924D0 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtn4ip1Q924D0 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtn4ip1Q924D0 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtn4ip1Q924D0 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtn4ip1Q924D0 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtn4ip1Q924D0 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtn4ip1Q924D0 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtn4ip1Q924D0 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtn4ip1Q924D0 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtn4ip1Q924D0 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtn4ip1Q924D0 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtn4ip1Q924D0 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtn4ip1Q924D0 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtn4ip1Q924D0 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtn4ip1Q924D0 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtn4ip1Q924D0 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtn4ip1Q924D0 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtn4ip1Q924D0 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtn4ip1Q924D0 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtn4ip1Q924D0 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtn4ip1Q924D0 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtn4ip1Q924D0 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtn4ip1Q924D0 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtn4ip1Q924D0 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms