Protein–RNA interactions for Protein: Q922U1

Prpf3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf3Q922U1 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prpf3Q922U1 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prpf3Q922U1 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prpf3Q922U1 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prpf3Q922U1 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Prpf3Q922U1 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prpf3Q922U1 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prpf3Q922U1 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prpf3Q922U1 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prpf3Q922U1 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Prpf3Q922U1 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prpf3Q922U1 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prpf3Q922U1 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prpf3Q922U1 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prpf3Q922U1 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prpf3Q922U1 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prpf3Q922U1 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prpf3Q922U1 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prpf3Q922U1 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prpf3Q922U1 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prpf3Q922U1 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prpf3Q922U1 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prpf3Q922U1 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prpf3Q922U1 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Prpf3Q922U1 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prpf3Q922U1 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prpf3Q922U1 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prpf3Q922U1 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prpf3Q922U1 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prpf3Q922U1 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Prpf3Q922U1 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prpf3Q922U1 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prpf3Q922U1 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prpf3Q922U1 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prpf3Q922U1 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prpf3Q922U1 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Prpf3Q922U1 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prpf3Q922U1 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prpf3Q922U1 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prpf3Q922U1 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Prpf3Q922U1 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prpf3Q922U1 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Prpf3Q922U1 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prpf3Q922U1 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prpf3Q922U1 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prpf3Q922U1 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Prpf3Q922U1 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prpf3Q922U1 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prpf3Q922U1 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Prpf3Q922U1 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prpf3Q922U1 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prpf3Q922U1 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prpf3Q922U1 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prpf3Q922U1 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prpf3Q922U1 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Prpf3Q922U1 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Prpf3Q922U1 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prpf3Q922U1 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prpf3Q922U1 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prpf3Q922U1 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prpf3Q922U1 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prpf3Q922U1 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prpf3Q922U1 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prpf3Q922U1 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prpf3Q922U1 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Prpf3Q922U1 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prpf3Q922U1 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prpf3Q922U1 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prpf3Q922U1 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prpf3Q922U1 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Prpf3Q922U1 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prpf3Q922U1 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prpf3Q922U1 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prpf3Q922U1 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prpf3Q922U1 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prpf3Q922U1 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prpf3Q922U1 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prpf3Q922U1 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Prpf3Q922U1 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prpf3Q922U1 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prpf3Q922U1 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prpf3Q922U1 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prpf3Q922U1 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prpf3Q922U1 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prpf3Q922U1 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prpf3Q922U1 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prpf3Q922U1 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prpf3Q922U1 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Prpf3Q922U1 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prpf3Q922U1 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prpf3Q922U1 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prpf3Q922U1 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prpf3Q922U1 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prpf3Q922U1 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prpf3Q922U1 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prpf3Q922U1 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prpf3Q922U1 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prpf3Q922U1 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prpf3Q922U1 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prpf3Q922U1 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms