Protein–RNA interactions for Protein: Q922J3

Clip1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip1Q922J3 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Clip1Q922J3 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Clip1Q922J3 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Clip1Q922J3 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Clip1Q922J3 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Clip1Q922J3 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Clip1Q922J3 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Clip1Q922J3 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Clip1Q922J3 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Clip1Q922J3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Clip1Q922J3 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Clip1Q922J3 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Clip1Q922J3 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Clip1Q922J3 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Clip1Q922J3 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Clip1Q922J3 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Clip1Q922J3 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Clip1Q922J3 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Clip1Q922J3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Clip1Q922J3 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Clip1Q922J3 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Clip1Q922J3 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Clip1Q922J3 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Clip1Q922J3 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Clip1Q922J3 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Clip1Q922J3 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Clip1Q922J3 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Clip1Q922J3 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Clip1Q922J3 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Clip1Q922J3 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Clip1Q922J3 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Clip1Q922J3 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Clip1Q922J3 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Clip1Q922J3 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Clip1Q922J3 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Clip1Q922J3 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Clip1Q922J3 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Clip1Q922J3 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Clip1Q922J3 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Clip1Q922J3 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Clip1Q922J3 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Clip1Q922J3 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Clip1Q922J3 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Clip1Q922J3 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Clip1Q922J3 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Clip1Q922J3 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Clip1Q922J3 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Clip1Q922J3 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Clip1Q922J3 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Clip1Q922J3 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Clip1Q922J3 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Clip1Q922J3 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Clip1Q922J3 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Clip1Q922J3 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Clip1Q922J3 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Clip1Q922J3 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Clip1Q922J3 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Clip1Q922J3 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Clip1Q922J3 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Clip1Q922J3 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Clip1Q922J3 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Clip1Q922J3 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Clip1Q922J3 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Clip1Q922J3 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Clip1Q922J3 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Clip1Q922J3 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Clip1Q922J3 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Clip1Q922J3 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Clip1Q922J3 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Clip1Q922J3 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Clip1Q922J3 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Clip1Q922J3 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Clip1Q922J3 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Clip1Q922J3 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Clip1Q922J3 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Clip1Q922J3 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Clip1Q922J3 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Clip1Q922J3 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Clip1Q922J3 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Clip1Q922J3 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Clip1Q922J3 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Clip1Q922J3 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Clip1Q922J3 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Clip1Q922J3 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Clip1Q922J3 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Clip1Q922J3 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Clip1Q922J3 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Clip1Q922J3 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Clip1Q922J3 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Clip1Q922J3 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Clip1Q922J3 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Clip1Q922J3 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Clip1Q922J3 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Clip1Q922J3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Clip1Q922J3 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Clip1Q922J3 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Clip1Q922J3 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Clip1Q922J3 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Clip1Q922J3 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Clip1Q922J3 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms