Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ1

Pde6c, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', mousemouse

Predictions only

Length 861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6cQ91ZQ1 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Pde6cQ91ZQ1 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pde6cQ91ZQ1 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pde6cQ91ZQ1 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pde6cQ91ZQ1 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pde6cQ91ZQ1 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pde6cQ91ZQ1 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pde6cQ91ZQ1 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pde6cQ91ZQ1 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pde6cQ91ZQ1 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pde6cQ91ZQ1 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pde6cQ91ZQ1 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pde6cQ91ZQ1 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Pde6cQ91ZQ1 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Pde6cQ91ZQ1 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pde6cQ91ZQ1 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pde6cQ91ZQ1 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Pde6cQ91ZQ1 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pde6cQ91ZQ1 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pde6cQ91ZQ1 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pde6cQ91ZQ1 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pde6cQ91ZQ1 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pde6cQ91ZQ1 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pde6cQ91ZQ1 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pde6cQ91ZQ1 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pde6cQ91ZQ1 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pde6cQ91ZQ1 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pde6cQ91ZQ1 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pde6cQ91ZQ1 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pde6cQ91ZQ1 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pde6cQ91ZQ1 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Pde6cQ91ZQ1 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pde6cQ91ZQ1 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pde6cQ91ZQ1 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pde6cQ91ZQ1 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pde6cQ91ZQ1 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pde6cQ91ZQ1 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pde6cQ91ZQ1 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pde6cQ91ZQ1 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pde6cQ91ZQ1 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pde6cQ91ZQ1 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pde6cQ91ZQ1 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pde6cQ91ZQ1 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pde6cQ91ZQ1 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pde6cQ91ZQ1 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pde6cQ91ZQ1 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pde6cQ91ZQ1 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pde6cQ91ZQ1 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pde6cQ91ZQ1 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pde6cQ91ZQ1 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Pde6cQ91ZQ1 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pde6cQ91ZQ1 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pde6cQ91ZQ1 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pde6cQ91ZQ1 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pde6cQ91ZQ1 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pde6cQ91ZQ1 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pde6cQ91ZQ1 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pde6cQ91ZQ1 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pde6cQ91ZQ1 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pde6cQ91ZQ1 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Pde6cQ91ZQ1 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
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Pde6cQ91ZQ1 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pde6cQ91ZQ1 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
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Pde6cQ91ZQ1 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
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Pde6cQ91ZQ1 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pde6cQ91ZQ1 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pde6cQ91ZQ1 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pde6cQ91ZQ1 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pde6cQ91ZQ1 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pde6cQ91ZQ1 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pde6cQ91ZQ1 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pde6cQ91ZQ1 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pde6cQ91ZQ1 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pde6cQ91ZQ1 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pde6cQ91ZQ1 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pde6cQ91ZQ1 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Pde6cQ91ZQ1 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pde6cQ91ZQ1 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pde6cQ91ZQ1 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pde6cQ91ZQ1 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pde6cQ91ZQ1 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pde6cQ91ZQ1 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pde6cQ91ZQ1 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pde6cQ91ZQ1 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pde6cQ91ZQ1 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pde6cQ91ZQ1 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pde6cQ91ZQ1 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pde6cQ91ZQ1 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
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Pde6cQ91ZQ1 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms