Protein–RNA interactions for Protein: Q91W18

Tdrd3, Tudor domain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 743 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd3Q91W18 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tdrd3Q91W18 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tdrd3Q91W18 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tdrd3Q91W18 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tdrd3Q91W18 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tdrd3Q91W18 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tdrd3Q91W18 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tdrd3Q91W18 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tdrd3Q91W18 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tdrd3Q91W18 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tdrd3Q91W18 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tdrd3Q91W18 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tdrd3Q91W18 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Tdrd3Q91W18 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Tdrd3Q91W18 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tdrd3Q91W18 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tdrd3Q91W18 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tdrd3Q91W18 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tdrd3Q91W18 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tdrd3Q91W18 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tdrd3Q91W18 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tdrd3Q91W18 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tdrd3Q91W18 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tdrd3Q91W18 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tdrd3Q91W18 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tdrd3Q91W18 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tdrd3Q91W18 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Tdrd3Q91W18 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tdrd3Q91W18 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tdrd3Q91W18 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tdrd3Q91W18 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tdrd3Q91W18 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tdrd3Q91W18 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tdrd3Q91W18 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tdrd3Q91W18 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tdrd3Q91W18 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tdrd3Q91W18 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tdrd3Q91W18 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Tdrd3Q91W18 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tdrd3Q91W18 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tdrd3Q91W18 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tdrd3Q91W18 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tdrd3Q91W18 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tdrd3Q91W18 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tdrd3Q91W18 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tdrd3Q91W18 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tdrd3Q91W18 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tdrd3Q91W18 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tdrd3Q91W18 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tdrd3Q91W18 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tdrd3Q91W18 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tdrd3Q91W18 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tdrd3Q91W18 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tdrd3Q91W18 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tdrd3Q91W18 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tdrd3Q91W18 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tdrd3Q91W18 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tdrd3Q91W18 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tdrd3Q91W18 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tdrd3Q91W18 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tdrd3Q91W18 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tdrd3Q91W18 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tdrd3Q91W18 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tdrd3Q91W18 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tdrd3Q91W18 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tdrd3Q91W18 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tdrd3Q91W18 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tdrd3Q91W18 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tdrd3Q91W18 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Tdrd3Q91W18 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tdrd3Q91W18 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tdrd3Q91W18 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tdrd3Q91W18 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tdrd3Q91W18 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tdrd3Q91W18 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tdrd3Q91W18 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tdrd3Q91W18 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tdrd3Q91W18 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tdrd3Q91W18 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tdrd3Q91W18 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tdrd3Q91W18 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tdrd3Q91W18 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tdrd3Q91W18 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tdrd3Q91W18 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tdrd3Q91W18 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tdrd3Q91W18 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tdrd3Q91W18 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tdrd3Q91W18 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tdrd3Q91W18 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tdrd3Q91W18 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tdrd3Q91W18 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tdrd3Q91W18 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tdrd3Q91W18 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tdrd3Q91W18 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Tdrd3Q91W18 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tdrd3Q91W18 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tdrd3Q91W18 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tdrd3Q91W18 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tdrd3Q91W18 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tdrd3Q91W18 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms