Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam20bQ8VCS3 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam20bQ8VCS3 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam20bQ8VCS3 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam20bQ8VCS3 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam20bQ8VCS3 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam20bQ8VCS3 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam20bQ8VCS3 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam20bQ8VCS3 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam20bQ8VCS3 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam20bQ8VCS3 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam20bQ8VCS3 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam20bQ8VCS3 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam20bQ8VCS3 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam20bQ8VCS3 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam20bQ8VCS3 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam20bQ8VCS3 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam20bQ8VCS3 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam20bQ8VCS3 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam20bQ8VCS3 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam20bQ8VCS3 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam20bQ8VCS3 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam20bQ8VCS3 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam20bQ8VCS3 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam20bQ8VCS3 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam20bQ8VCS3 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam20bQ8VCS3 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam20bQ8VCS3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam20bQ8VCS3 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam20bQ8VCS3 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam20bQ8VCS3 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam20bQ8VCS3 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam20bQ8VCS3 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam20bQ8VCS3 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam20bQ8VCS3 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam20bQ8VCS3 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam20bQ8VCS3 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam20bQ8VCS3 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam20bQ8VCS3 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam20bQ8VCS3 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam20bQ8VCS3 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam20bQ8VCS3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam20bQ8VCS3 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam20bQ8VCS3 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam20bQ8VCS3 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam20bQ8VCS3 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam20bQ8VCS3 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam20bQ8VCS3 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam20bQ8VCS3 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam20bQ8VCS3 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam20bQ8VCS3 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam20bQ8VCS3 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam20bQ8VCS3 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam20bQ8VCS3 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam20bQ8VCS3 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam20bQ8VCS3 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam20bQ8VCS3 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam20bQ8VCS3 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam20bQ8VCS3 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam20bQ8VCS3 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam20bQ8VCS3 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam20bQ8VCS3 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam20bQ8VCS3 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam20bQ8VCS3 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam20bQ8VCS3 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam20bQ8VCS3 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam20bQ8VCS3 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam20bQ8VCS3 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam20bQ8VCS3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam20bQ8VCS3 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam20bQ8VCS3 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam20bQ8VCS3 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam20bQ8VCS3 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fam20bQ8VCS3 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fam20bQ8VCS3 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fam20bQ8VCS3 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fam20bQ8VCS3 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fam20bQ8VCS3 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fam20bQ8VCS3 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fam20bQ8VCS3 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fam20bQ8VCS3 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fam20bQ8VCS3 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fam20bQ8VCS3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fam20bQ8VCS3 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fam20bQ8VCS3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fam20bQ8VCS3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fam20bQ8VCS3 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fam20bQ8VCS3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fam20bQ8VCS3 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fam20bQ8VCS3 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fam20bQ8VCS3 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fam20bQ8VCS3 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fam20bQ8VCS3 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fam20bQ8VCS3 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fam20bQ8VCS3 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fam20bQ8VCS3 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fam20bQ8VCS3 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fam20bQ8VCS3 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fam20bQ8VCS3 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fam20bQ8VCS3 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
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