Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Ubxn4Q8VCH8 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ubxn4Q8VCH8 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ubxn4Q8VCH8 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ubxn4Q8VCH8 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ubxn4Q8VCH8 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ubxn4Q8VCH8 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ubxn4Q8VCH8 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ubxn4Q8VCH8 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ubxn4Q8VCH8 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ubxn4Q8VCH8 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ubxn4Q8VCH8 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ubxn4Q8VCH8 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ubxn4Q8VCH8 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ubxn4Q8VCH8 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ubxn4Q8VCH8 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ubxn4Q8VCH8 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ubxn4Q8VCH8 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ubxn4Q8VCH8 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ubxn4Q8VCH8 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ubxn4Q8VCH8 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ubxn4Q8VCH8 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ubxn4Q8VCH8 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ubxn4Q8VCH8 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ubxn4Q8VCH8 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ubxn4Q8VCH8 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ubxn4Q8VCH8 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ubxn4Q8VCH8 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ubxn4Q8VCH8 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ubxn4Q8VCH8 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ubxn4Q8VCH8 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ubxn4Q8VCH8 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ubxn4Q8VCH8 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ubxn4Q8VCH8 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ubxn4Q8VCH8 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ubxn4Q8VCH8 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ubxn4Q8VCH8 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ubxn4Q8VCH8 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ubxn4Q8VCH8 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ubxn4Q8VCH8 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ubxn4Q8VCH8 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ubxn4Q8VCH8 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ubxn4Q8VCH8 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ubxn4Q8VCH8 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ubxn4Q8VCH8 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ubxn4Q8VCH8 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ubxn4Q8VCH8 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ubxn4Q8VCH8 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ubxn4Q8VCH8 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ubxn4Q8VCH8 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ubxn4Q8VCH8 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ubxn4Q8VCH8 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ubxn4Q8VCH8 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ubxn4Q8VCH8 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ubxn4Q8VCH8 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ubxn4Q8VCH8 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ubxn4Q8VCH8 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ubxn4Q8VCH8 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Ubxn4Q8VCH8 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ubxn4Q8VCH8 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ubxn4Q8VCH8 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ubxn4Q8VCH8 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ubxn4Q8VCH8 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ubxn4Q8VCH8 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ubxn4Q8VCH8 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ubxn4Q8VCH8 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ubxn4Q8VCH8 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Ubxn4Q8VCH8 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Ubxn4Q8VCH8 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ubxn4Q8VCH8 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ubxn4Q8VCH8 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ubxn4Q8VCH8 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Ubxn4Q8VCH8 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ubxn4Q8VCH8 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ubxn4Q8VCH8 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ubxn4Q8VCH8 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ubxn4Q8VCH8 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ubxn4Q8VCH8 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ubxn4Q8VCH8 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ubxn4Q8VCH8 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ubxn4Q8VCH8 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ubxn4Q8VCH8 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ubxn4Q8VCH8 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ubxn4Q8VCH8 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ubxn4Q8VCH8 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Ubxn4Q8VCH8 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ubxn4Q8VCH8 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ubxn4Q8VCH8 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ubxn4Q8VCH8 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ubxn4Q8VCH8 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ubxn4Q8VCH8 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ubxn4Q8VCH8 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ubxn4Q8VCH8 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ubxn4Q8VCH8 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ubxn4Q8VCH8 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ubxn4Q8VCH8 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ubxn4Q8VCH8 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ubxn4Q8VCH8 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ubxn4Q8VCH8 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ubxn4Q8VCH8 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
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