Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4Y8

Rttn, Rotatin, mousemouse

Predictions only

Length 2,226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RttnQ8R4Y8 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RttnQ8R4Y8 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RttnQ8R4Y8 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RttnQ8R4Y8 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RttnQ8R4Y8 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
RttnQ8R4Y8 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RttnQ8R4Y8 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RttnQ8R4Y8 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RttnQ8R4Y8 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RttnQ8R4Y8 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RttnQ8R4Y8 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RttnQ8R4Y8 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RttnQ8R4Y8 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RttnQ8R4Y8 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RttnQ8R4Y8 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RttnQ8R4Y8 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RttnQ8R4Y8 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RttnQ8R4Y8 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RttnQ8R4Y8 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RttnQ8R4Y8 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RttnQ8R4Y8 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RttnQ8R4Y8 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RttnQ8R4Y8 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RttnQ8R4Y8 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RttnQ8R4Y8 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RttnQ8R4Y8 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RttnQ8R4Y8 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RttnQ8R4Y8 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RttnQ8R4Y8 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RttnQ8R4Y8 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RttnQ8R4Y8 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RttnQ8R4Y8 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RttnQ8R4Y8 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RttnQ8R4Y8 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RttnQ8R4Y8 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RttnQ8R4Y8 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RttnQ8R4Y8 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RttnQ8R4Y8 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RttnQ8R4Y8 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RttnQ8R4Y8 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RttnQ8R4Y8 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RttnQ8R4Y8 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RttnQ8R4Y8 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RttnQ8R4Y8 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RttnQ8R4Y8 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RttnQ8R4Y8 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RttnQ8R4Y8 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RttnQ8R4Y8 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RttnQ8R4Y8 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RttnQ8R4Y8 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RttnQ8R4Y8 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RttnQ8R4Y8 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RttnQ8R4Y8 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RttnQ8R4Y8 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RttnQ8R4Y8 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RttnQ8R4Y8 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RttnQ8R4Y8 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RttnQ8R4Y8 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RttnQ8R4Y8 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RttnQ8R4Y8 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RttnQ8R4Y8 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RttnQ8R4Y8 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RttnQ8R4Y8 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RttnQ8R4Y8 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RttnQ8R4Y8 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RttnQ8R4Y8 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RttnQ8R4Y8 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RttnQ8R4Y8 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RttnQ8R4Y8 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RttnQ8R4Y8 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RttnQ8R4Y8 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RttnQ8R4Y8 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RttnQ8R4Y8 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RttnQ8R4Y8 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RttnQ8R4Y8 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RttnQ8R4Y8 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RttnQ8R4Y8 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RttnQ8R4Y8 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RttnQ8R4Y8 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RttnQ8R4Y8 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RttnQ8R4Y8 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RttnQ8R4Y8 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RttnQ8R4Y8 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RttnQ8R4Y8 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RttnQ8R4Y8 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RttnQ8R4Y8 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RttnQ8R4Y8 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RttnQ8R4Y8 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RttnQ8R4Y8 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RttnQ8R4Y8 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RttnQ8R4Y8 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RttnQ8R4Y8 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RttnQ8R4Y8 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RttnQ8R4Y8 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RttnQ8R4Y8 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RttnQ8R4Y8 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RttnQ8R4Y8 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RttnQ8R4Y8 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RttnQ8R4Y8 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RttnQ8R4Y8 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms