Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Hecw1Q8K4P8 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Hecw1Q8K4P8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Hecw1Q8K4P8 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Hecw1Q8K4P8 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Hecw1Q8K4P8 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Hecw1Q8K4P8 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Hecw1Q8K4P8 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Hecw1Q8K4P8 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Hecw1Q8K4P8 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Hecw1Q8K4P8 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Hecw1Q8K4P8 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Hecw1Q8K4P8 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Hecw1Q8K4P8 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Hecw1Q8K4P8 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Hecw1Q8K4P8 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Hecw1Q8K4P8 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Hecw1Q8K4P8 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Hecw1Q8K4P8 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Hecw1Q8K4P8 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Hecw1Q8K4P8 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Hecw1Q8K4P8 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Hecw1Q8K4P8 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Hecw1Q8K4P8 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Hecw1Q8K4P8 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Hecw1Q8K4P8 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Hecw1Q8K4P8 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Hecw1Q8K4P8 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Hecw1Q8K4P8 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Hecw1Q8K4P8 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Hecw1Q8K4P8 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Hecw1Q8K4P8 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Hecw1Q8K4P8 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Hecw1Q8K4P8 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Hecw1Q8K4P8 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Hecw1Q8K4P8 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Hecw1Q8K4P8 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Hecw1Q8K4P8 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Hecw1Q8K4P8 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Hecw1Q8K4P8 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Hecw1Q8K4P8 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Hecw1Q8K4P8 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Hecw1Q8K4P8 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Hecw1Q8K4P8 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Hecw1Q8K4P8 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Hecw1Q8K4P8 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Hecw1Q8K4P8 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Hecw1Q8K4P8 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Hecw1Q8K4P8 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Hecw1Q8K4P8 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Hecw1Q8K4P8 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Hecw1Q8K4P8 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Hecw1Q8K4P8 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Hecw1Q8K4P8 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Hecw1Q8K4P8 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Hecw1Q8K4P8 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Hecw1Q8K4P8 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Hecw1Q8K4P8 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Hecw1Q8K4P8 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Hecw1Q8K4P8 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Hecw1Q8K4P8 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Hecw1Q8K4P8 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Hecw1Q8K4P8 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Hecw1Q8K4P8 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Hecw1Q8K4P8 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Hecw1Q8K4P8 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Hecw1Q8K4P8 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Hecw1Q8K4P8 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Hecw1Q8K4P8 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Hecw1Q8K4P8 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Hecw1Q8K4P8 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Hecw1Q8K4P8 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Hecw1Q8K4P8 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Hecw1Q8K4P8 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Hecw1Q8K4P8 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Hecw1Q8K4P8 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Hecw1Q8K4P8 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Hecw1Q8K4P8 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Hecw1Q8K4P8 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
Hecw1Q8K4P8 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Hecw1Q8K4P8 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Hecw1Q8K4P8 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Hecw1Q8K4P8 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Hecw1Q8K4P8 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Hecw1Q8K4P8 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Hecw1Q8K4P8 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Hecw1Q8K4P8 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Hecw1Q8K4P8 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Hecw1Q8K4P8 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Hecw1Q8K4P8 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Hecw1Q8K4P8 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Hecw1Q8K4P8 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Hecw1Q8K4P8 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Hecw1Q8K4P8 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Hecw1Q8K4P8 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Hecw1Q8K4P8 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Hecw1Q8K4P8 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Hecw1Q8K4P8 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Hecw1Q8K4P8 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Hecw1Q8K4P8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms