Protein–RNA interactions for Protein: Q8K448

Abca5, ATP-binding cassette sub-family A member 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abca5Q8K448 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Abca5Q8K448 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Abca5Q8K448 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Abca5Q8K448 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Abca5Q8K448 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Abca5Q8K448 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Abca5Q8K448 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Abca5Q8K448 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Abca5Q8K448 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Abca5Q8K448 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Abca5Q8K448 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Abca5Q8K448 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Abca5Q8K448 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Abca5Q8K448 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Abca5Q8K448 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Abca5Q8K448 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Abca5Q8K448 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Abca5Q8K448 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Abca5Q8K448 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Abca5Q8K448 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Abca5Q8K448 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Abca5Q8K448 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Abca5Q8K448 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Abca5Q8K448 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Abca5Q8K448 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Abca5Q8K448 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Abca5Q8K448 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Abca5Q8K448 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Abca5Q8K448 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Abca5Q8K448 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Abca5Q8K448 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Abca5Q8K448 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Abca5Q8K448 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Abca5Q8K448 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Abca5Q8K448 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Abca5Q8K448 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Abca5Q8K448 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Abca5Q8K448 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Abca5Q8K448 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Abca5Q8K448 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Abca5Q8K448 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Abca5Q8K448 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Abca5Q8K448 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Abca5Q8K448 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Abca5Q8K448 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Abca5Q8K448 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Abca5Q8K448 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Abca5Q8K448 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Abca5Q8K448 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Abca5Q8K448 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Abca5Q8K448 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Abca5Q8K448 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Abca5Q8K448 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Abca5Q8K448 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Abca5Q8K448 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Abca5Q8K448 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Abca5Q8K448 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Abca5Q8K448 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Abca5Q8K448 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Abca5Q8K448 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Abca5Q8K448 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Abca5Q8K448 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Abca5Q8K448 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Abca5Q8K448 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Abca5Q8K448 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Abca5Q8K448 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Abca5Q8K448 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Abca5Q8K448 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Abca5Q8K448 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Abca5Q8K448 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Abca5Q8K448 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Abca5Q8K448 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Abca5Q8K448 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Abca5Q8K448 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Abca5Q8K448 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Abca5Q8K448 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Abca5Q8K448 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Abca5Q8K448 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Abca5Q8K448 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Abca5Q8K448 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Abca5Q8K448 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Abca5Q8K448 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Abca5Q8K448 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Abca5Q8K448 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Abca5Q8K448 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Abca5Q8K448 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Abca5Q8K448 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Abca5Q8K448 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Abca5Q8K448 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Abca5Q8K448 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Abca5Q8K448 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
Abca5Q8K448 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Abca5Q8K448 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Abca5Q8K448 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Abca5Q8K448 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Abca5Q8K448 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Abca5Q8K448 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Abca5Q8K448 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
Abca5Q8K448 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Abca5Q8K448 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms