Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
OptnQ8K3K8 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
OptnQ8K3K8 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
OptnQ8K3K8 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
OptnQ8K3K8 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
OptnQ8K3K8 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
OptnQ8K3K8 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
OptnQ8K3K8 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
OptnQ8K3K8 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
OptnQ8K3K8 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
OptnQ8K3K8 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
OptnQ8K3K8 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
OptnQ8K3K8 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
OptnQ8K3K8 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
OptnQ8K3K8 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
OptnQ8K3K8 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
OptnQ8K3K8 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
OptnQ8K3K8 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
OptnQ8K3K8 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
OptnQ8K3K8 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
OptnQ8K3K8 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
OptnQ8K3K8 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
OptnQ8K3K8 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
OptnQ8K3K8 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
OptnQ8K3K8 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
OptnQ8K3K8 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
OptnQ8K3K8 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
OptnQ8K3K8 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
OptnQ8K3K8 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
OptnQ8K3K8 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
OptnQ8K3K8 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
OptnQ8K3K8 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
OptnQ8K3K8 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
OptnQ8K3K8 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
OptnQ8K3K8 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
OptnQ8K3K8 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
OptnQ8K3K8 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
OptnQ8K3K8 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
OptnQ8K3K8 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
OptnQ8K3K8 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
OptnQ8K3K8 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
OptnQ8K3K8 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
OptnQ8K3K8 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
OptnQ8K3K8 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
OptnQ8K3K8 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
OptnQ8K3K8 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
OptnQ8K3K8 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
OptnQ8K3K8 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
OptnQ8K3K8 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
OptnQ8K3K8 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
OptnQ8K3K8 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
OptnQ8K3K8 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
OptnQ8K3K8 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
OptnQ8K3K8 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
OptnQ8K3K8 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
OptnQ8K3K8 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
OptnQ8K3K8 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
OptnQ8K3K8 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
OptnQ8K3K8 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
OptnQ8K3K8 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
OptnQ8K3K8 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
OptnQ8K3K8 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
OptnQ8K3K8 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
OptnQ8K3K8 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
OptnQ8K3K8 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
OptnQ8K3K8 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
OptnQ8K3K8 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
OptnQ8K3K8 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
OptnQ8K3K8 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
OptnQ8K3K8 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
OptnQ8K3K8 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
OptnQ8K3K8 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
OptnQ8K3K8 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
OptnQ8K3K8 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
OptnQ8K3K8 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
OptnQ8K3K8 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
OptnQ8K3K8 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
OptnQ8K3K8 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
OptnQ8K3K8 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
OptnQ8K3K8 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
OptnQ8K3K8 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
OptnQ8K3K8 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
OptnQ8K3K8 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
OptnQ8K3K8 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
OptnQ8K3K8 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
OptnQ8K3K8 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
OptnQ8K3K8 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
OptnQ8K3K8 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
OptnQ8K3K8 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
OptnQ8K3K8 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
OptnQ8K3K8 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
OptnQ8K3K8 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
OptnQ8K3K8 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
OptnQ8K3K8 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
OptnQ8K3K8 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
OptnQ8K3K8 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
OptnQ8K3K8 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
OptnQ8K3K8 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
OptnQ8K3K8 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
OptnQ8K3K8 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms