Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Y9

Ccm2, Cerebral cavernous malformations protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccm2Q8K2Y9 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccm2Q8K2Y9 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccm2Q8K2Y9 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccm2Q8K2Y9 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccm2Q8K2Y9 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccm2Q8K2Y9 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccm2Q8K2Y9 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccm2Q8K2Y9 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccm2Q8K2Y9 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccm2Q8K2Y9 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccm2Q8K2Y9 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccm2Q8K2Y9 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccm2Q8K2Y9 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccm2Q8K2Y9 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccm2Q8K2Y9 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccm2Q8K2Y9 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccm2Q8K2Y9 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccm2Q8K2Y9 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccm2Q8K2Y9 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccm2Q8K2Y9 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccm2Q8K2Y9 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccm2Q8K2Y9 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccm2Q8K2Y9 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccm2Q8K2Y9 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccm2Q8K2Y9 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccm2Q8K2Y9 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccm2Q8K2Y9 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccm2Q8K2Y9 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccm2Q8K2Y9 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccm2Q8K2Y9 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccm2Q8K2Y9 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccm2Q8K2Y9 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccm2Q8K2Y9 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccm2Q8K2Y9 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccm2Q8K2Y9 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccm2Q8K2Y9 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccm2Q8K2Y9 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccm2Q8K2Y9 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccm2Q8K2Y9 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccm2Q8K2Y9 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccm2Q8K2Y9 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccm2Q8K2Y9 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccm2Q8K2Y9 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccm2Q8K2Y9 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccm2Q8K2Y9 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccm2Q8K2Y9 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccm2Q8K2Y9 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccm2Q8K2Y9 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccm2Q8K2Y9 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccm2Q8K2Y9 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccm2Q8K2Y9 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccm2Q8K2Y9 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccm2Q8K2Y9 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccm2Q8K2Y9 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccm2Q8K2Y9 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccm2Q8K2Y9 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccm2Q8K2Y9 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccm2Q8K2Y9 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccm2Q8K2Y9 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccm2Q8K2Y9 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccm2Q8K2Y9 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccm2Q8K2Y9 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccm2Q8K2Y9 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccm2Q8K2Y9 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccm2Q8K2Y9 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccm2Q8K2Y9 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccm2Q8K2Y9 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccm2Q8K2Y9 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccm2Q8K2Y9 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccm2Q8K2Y9 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccm2Q8K2Y9 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccm2Q8K2Y9 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccm2Q8K2Y9 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccm2Q8K2Y9 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccm2Q8K2Y9 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccm2Q8K2Y9 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccm2Q8K2Y9 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccm2Q8K2Y9 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccm2Q8K2Y9 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccm2Q8K2Y9 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccm2Q8K2Y9 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccm2Q8K2Y9 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccm2Q8K2Y9 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccm2Q8K2Y9 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccm2Q8K2Y9 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccm2Q8K2Y9 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccm2Q8K2Y9 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccm2Q8K2Y9 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccm2Q8K2Y9 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccm2Q8K2Y9 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccm2Q8K2Y9 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccm2Q8K2Y9 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccm2Q8K2Y9 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccm2Q8K2Y9 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccm2Q8K2Y9 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccm2Q8K2Y9 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccm2Q8K2Y9 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccm2Q8K2Y9 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccm2Q8K2Y9 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccm2Q8K2Y9 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms