Protein–RNA interactions for Protein: Q8K285

Fcho1, F-BAR domain only protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcho1Q8K285 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fcho1Q8K285 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fcho1Q8K285 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fcho1Q8K285 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fcho1Q8K285 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fcho1Q8K285 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fcho1Q8K285 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fcho1Q8K285 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fcho1Q8K285 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Fcho1Q8K285 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fcho1Q8K285 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fcho1Q8K285 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fcho1Q8K285 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fcho1Q8K285 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fcho1Q8K285 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fcho1Q8K285 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fcho1Q8K285 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fcho1Q8K285 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fcho1Q8K285 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fcho1Q8K285 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fcho1Q8K285 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fcho1Q8K285 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fcho1Q8K285 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fcho1Q8K285 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fcho1Q8K285 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fcho1Q8K285 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fcho1Q8K285 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fcho1Q8K285 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fcho1Q8K285 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fcho1Q8K285 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fcho1Q8K285 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fcho1Q8K285 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fcho1Q8K285 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fcho1Q8K285 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fcho1Q8K285 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fcho1Q8K285 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fcho1Q8K285 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fcho1Q8K285 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fcho1Q8K285 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fcho1Q8K285 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fcho1Q8K285 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fcho1Q8K285 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fcho1Q8K285 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fcho1Q8K285 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fcho1Q8K285 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fcho1Q8K285 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fcho1Q8K285 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fcho1Q8K285 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fcho1Q8K285 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fcho1Q8K285 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Fcho1Q8K285 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Fcho1Q8K285 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fcho1Q8K285 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fcho1Q8K285 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fcho1Q8K285 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Fcho1Q8K285 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fcho1Q8K285 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fcho1Q8K285 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fcho1Q8K285 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fcho1Q8K285 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fcho1Q8K285 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fcho1Q8K285 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fcho1Q8K285 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Fcho1Q8K285 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fcho1Q8K285 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fcho1Q8K285 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fcho1Q8K285 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fcho1Q8K285 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fcho1Q8K285 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fcho1Q8K285 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fcho1Q8K285 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fcho1Q8K285 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fcho1Q8K285 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Fcho1Q8K285 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fcho1Q8K285 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fcho1Q8K285 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fcho1Q8K285 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Fcho1Q8K285 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fcho1Q8K285 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Fcho1Q8K285 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fcho1Q8K285 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fcho1Q8K285 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fcho1Q8K285 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fcho1Q8K285 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fcho1Q8K285 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fcho1Q8K285 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fcho1Q8K285 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Fcho1Q8K285 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fcho1Q8K285 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fcho1Q8K285 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fcho1Q8K285 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fcho1Q8K285 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fcho1Q8K285 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fcho1Q8K285 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fcho1Q8K285 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fcho1Q8K285 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fcho1Q8K285 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fcho1Q8K285 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fcho1Q8K285 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fcho1Q8K285 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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