Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1J5

Sde2, Replication stress response regulator SDE2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sde2Q8K1J5 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sde2Q8K1J5 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sde2Q8K1J5 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sde2Q8K1J5 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sde2Q8K1J5 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sde2Q8K1J5 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sde2Q8K1J5 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sde2Q8K1J5 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sde2Q8K1J5 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sde2Q8K1J5 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sde2Q8K1J5 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sde2Q8K1J5 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Sde2Q8K1J5 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sde2Q8K1J5 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sde2Q8K1J5 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Sde2Q8K1J5 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sde2Q8K1J5 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sde2Q8K1J5 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sde2Q8K1J5 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sde2Q8K1J5 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sde2Q8K1J5 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sde2Q8K1J5 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sde2Q8K1J5 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sde2Q8K1J5 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sde2Q8K1J5 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sde2Q8K1J5 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sde2Q8K1J5 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sde2Q8K1J5 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sde2Q8K1J5 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sde2Q8K1J5 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sde2Q8K1J5 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sde2Q8K1J5 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Sde2Q8K1J5 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Sde2Q8K1J5 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sde2Q8K1J5 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Sde2Q8K1J5 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sde2Q8K1J5 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sde2Q8K1J5 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sde2Q8K1J5 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sde2Q8K1J5 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sde2Q8K1J5 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sde2Q8K1J5 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sde2Q8K1J5 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sde2Q8K1J5 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sde2Q8K1J5 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sde2Q8K1J5 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sde2Q8K1J5 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sde2Q8K1J5 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sde2Q8K1J5 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sde2Q8K1J5 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Sde2Q8K1J5 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Sde2Q8K1J5 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sde2Q8K1J5 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Sde2Q8K1J5 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sde2Q8K1J5 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sde2Q8K1J5 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sde2Q8K1J5 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sde2Q8K1J5 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sde2Q8K1J5 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Sde2Q8K1J5 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sde2Q8K1J5 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sde2Q8K1J5 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sde2Q8K1J5 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sde2Q8K1J5 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sde2Q8K1J5 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sde2Q8K1J5 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Sde2Q8K1J5 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sde2Q8K1J5 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sde2Q8K1J5 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sde2Q8K1J5 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sde2Q8K1J5 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sde2Q8K1J5 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sde2Q8K1J5 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sde2Q8K1J5 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sde2Q8K1J5 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sde2Q8K1J5 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sde2Q8K1J5 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sde2Q8K1J5 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sde2Q8K1J5 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sde2Q8K1J5 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sde2Q8K1J5 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sde2Q8K1J5 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sde2Q8K1J5 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sde2Q8K1J5 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sde2Q8K1J5 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sde2Q8K1J5 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sde2Q8K1J5 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sde2Q8K1J5 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sde2Q8K1J5 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Sde2Q8K1J5 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sde2Q8K1J5 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sde2Q8K1J5 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sde2Q8K1J5 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sde2Q8K1J5 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sde2Q8K1J5 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sde2Q8K1J5 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Sde2Q8K1J5 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sde2Q8K1J5 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sde2Q8K1J5 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sde2Q8K1J5 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms