Protein–RNA interactions for Protein: Q8K168

1700001C19Rik, RIKEN cDNA 1700001C19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700001C19RikQ8K168 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
1700001C19RikQ8K168 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
1700001C19RikQ8K168 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
1700001C19RikQ8K168 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
1700001C19RikQ8K168 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
1700001C19RikQ8K168 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
1700001C19RikQ8K168 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
1700001C19RikQ8K168 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
1700001C19RikQ8K168 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
1700001C19RikQ8K168 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
1700001C19RikQ8K168 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
1700001C19RikQ8K168 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
1700001C19RikQ8K168 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
1700001C19RikQ8K168 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
1700001C19RikQ8K168 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
1700001C19RikQ8K168 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
1700001C19RikQ8K168 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
1700001C19RikQ8K168 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
1700001C19RikQ8K168 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
1700001C19RikQ8K168 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
1700001C19RikQ8K168 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
1700001C19RikQ8K168 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
1700001C19RikQ8K168 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
1700001C19RikQ8K168 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
1700001C19RikQ8K168 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
1700001C19RikQ8K168 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
1700001C19RikQ8K168 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
1700001C19RikQ8K168 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
1700001C19RikQ8K168 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
1700001C19RikQ8K168 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
1700001C19RikQ8K168 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
1700001C19RikQ8K168 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
1700001C19RikQ8K168 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
1700001C19RikQ8K168 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
1700001C19RikQ8K168 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
1700001C19RikQ8K168 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
1700001C19RikQ8K168 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
1700001C19RikQ8K168 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
1700001C19RikQ8K168 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
1700001C19RikQ8K168 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
1700001C19RikQ8K168 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
1700001C19RikQ8K168 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
1700001C19RikQ8K168 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
1700001C19RikQ8K168 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
1700001C19RikQ8K168 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
1700001C19RikQ8K168 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
1700001C19RikQ8K168 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
1700001C19RikQ8K168 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
1700001C19RikQ8K168 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
1700001C19RikQ8K168 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
1700001C19RikQ8K168 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
1700001C19RikQ8K168 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
1700001C19RikQ8K168 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
1700001C19RikQ8K168 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
1700001C19RikQ8K168 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
1700001C19RikQ8K168 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
1700001C19RikQ8K168 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
1700001C19RikQ8K168 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
1700001C19RikQ8K168 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
1700001C19RikQ8K168 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
1700001C19RikQ8K168 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
1700001C19RikQ8K168 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
1700001C19RikQ8K168 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
1700001C19RikQ8K168 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
1700001C19RikQ8K168 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
1700001C19RikQ8K168 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
1700001C19RikQ8K168 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
1700001C19RikQ8K168 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
1700001C19RikQ8K168 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
1700001C19RikQ8K168 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
1700001C19RikQ8K168 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
1700001C19RikQ8K168 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
1700001C19RikQ8K168 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
1700001C19RikQ8K168 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
1700001C19RikQ8K168 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
1700001C19RikQ8K168 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
1700001C19RikQ8K168 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
1700001C19RikQ8K168 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
1700001C19RikQ8K168 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
1700001C19RikQ8K168 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
1700001C19RikQ8K168 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
1700001C19RikQ8K168 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
1700001C19RikQ8K168 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
1700001C19RikQ8K168 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
1700001C19RikQ8K168 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
1700001C19RikQ8K168 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
1700001C19RikQ8K168 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
1700001C19RikQ8K168 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
1700001C19RikQ8K168 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
1700001C19RikQ8K168 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700001C19RikQ8K168 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700001C19RikQ8K168 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700001C19RikQ8K168 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700001C19RikQ8K168 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700001C19RikQ8K168 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700001C19RikQ8K168 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700001C19RikQ8K168 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700001C19RikQ8K168 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
1700001C19RikQ8K168 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700001C19RikQ8K168 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms