Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf628Q8CJ78 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Znf628Q8CJ78 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Znf628Q8CJ78 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Znf628Q8CJ78 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Znf628Q8CJ78 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Znf628Q8CJ78 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Znf628Q8CJ78 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Znf628Q8CJ78 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Znf628Q8CJ78 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Znf628Q8CJ78 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Znf628Q8CJ78 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Znf628Q8CJ78 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Znf628Q8CJ78 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Znf628Q8CJ78 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Znf628Q8CJ78 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Znf628Q8CJ78 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Znf628Q8CJ78 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Znf628Q8CJ78 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Znf628Q8CJ78 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Znf628Q8CJ78 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Znf628Q8CJ78 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Znf628Q8CJ78 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Znf628Q8CJ78 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Znf628Q8CJ78 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Znf628Q8CJ78 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Znf628Q8CJ78 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Znf628Q8CJ78 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Znf628Q8CJ78 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Znf628Q8CJ78 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Znf628Q8CJ78 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Znf628Q8CJ78 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Znf628Q8CJ78 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Znf628Q8CJ78 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Znf628Q8CJ78 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Znf628Q8CJ78 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Znf628Q8CJ78 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Znf628Q8CJ78 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Znf628Q8CJ78 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Znf628Q8CJ78 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Znf628Q8CJ78 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Znf628Q8CJ78 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Znf628Q8CJ78 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Znf628Q8CJ78 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Znf628Q8CJ78 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Znf628Q8CJ78 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Znf628Q8CJ78 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Znf628Q8CJ78 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Znf628Q8CJ78 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Znf628Q8CJ78 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Znf628Q8CJ78 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Znf628Q8CJ78 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Znf628Q8CJ78 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Znf628Q8CJ78 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Znf628Q8CJ78 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Znf628Q8CJ78 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Znf628Q8CJ78 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Znf628Q8CJ78 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Znf628Q8CJ78 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Znf628Q8CJ78 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Znf628Q8CJ78 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Znf628Q8CJ78 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Znf628Q8CJ78 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Znf628Q8CJ78 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Znf628Q8CJ78 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Znf628Q8CJ78 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Znf628Q8CJ78 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Znf628Q8CJ78 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Znf628Q8CJ78 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Znf628Q8CJ78 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Znf628Q8CJ78 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Znf628Q8CJ78 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Znf628Q8CJ78 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Znf628Q8CJ78 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Znf628Q8CJ78 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Znf628Q8CJ78 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Znf628Q8CJ78 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Znf628Q8CJ78 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Znf628Q8CJ78 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Znf628Q8CJ78 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Znf628Q8CJ78 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Znf628Q8CJ78 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Znf628Q8CJ78 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Znf628Q8CJ78 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Znf628Q8CJ78 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Znf628Q8CJ78 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Znf628Q8CJ78 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Znf628Q8CJ78 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Znf628Q8CJ78 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Znf628Q8CJ78 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Znf628Q8CJ78 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Znf628Q8CJ78 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Znf628Q8CJ78 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Znf628Q8CJ78 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Znf628Q8CJ78 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Znf628Q8CJ78 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Znf628Q8CJ78 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Znf628Q8CJ78 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Znf628Q8CJ78 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Znf628Q8CJ78 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Znf628Q8CJ78 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms