Protein–RNA interactions for Protein: Q8CH77

Nav1, Neuron navigator 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nav1Q8CH77 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nav1Q8CH77 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Nav1Q8CH77 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nav1Q8CH77 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nav1Q8CH77 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nav1Q8CH77 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nav1Q8CH77 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nav1Q8CH77 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nav1Q8CH77 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Nav1Q8CH77 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nav1Q8CH77 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nav1Q8CH77 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Nav1Q8CH77 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nav1Q8CH77 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Nav1Q8CH77 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nav1Q8CH77 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nav1Q8CH77 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nav1Q8CH77 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nav1Q8CH77 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nav1Q8CH77 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nav1Q8CH77 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nav1Q8CH77 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nav1Q8CH77 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nav1Q8CH77 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nav1Q8CH77 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nav1Q8CH77 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nav1Q8CH77 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nav1Q8CH77 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nav1Q8CH77 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nav1Q8CH77 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nav1Q8CH77 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nav1Q8CH77 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nav1Q8CH77 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Nav1Q8CH77 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nav1Q8CH77 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nav1Q8CH77 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nav1Q8CH77 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nav1Q8CH77 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nav1Q8CH77 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nav1Q8CH77 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nav1Q8CH77 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nav1Q8CH77 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nav1Q8CH77 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nav1Q8CH77 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nav1Q8CH77 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nav1Q8CH77 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nav1Q8CH77 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nav1Q8CH77 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Nav1Q8CH77 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nav1Q8CH77 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nav1Q8CH77 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nav1Q8CH77 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nav1Q8CH77 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nav1Q8CH77 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nav1Q8CH77 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nav1Q8CH77 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nav1Q8CH77 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nav1Q8CH77 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nav1Q8CH77 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nav1Q8CH77 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Nav1Q8CH77 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nav1Q8CH77 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nav1Q8CH77 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nav1Q8CH77 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nav1Q8CH77 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nav1Q8CH77 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nav1Q8CH77 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nav1Q8CH77 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nav1Q8CH77 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nav1Q8CH77 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nav1Q8CH77 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nav1Q8CH77 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nav1Q8CH77 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nav1Q8CH77 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nav1Q8CH77 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nav1Q8CH77 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Nav1Q8CH77 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Nav1Q8CH77 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Nav1Q8CH77 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nav1Q8CH77 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nav1Q8CH77 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nav1Q8CH77 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nav1Q8CH77 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nav1Q8CH77 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nav1Q8CH77 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nav1Q8CH77 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nav1Q8CH77 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nav1Q8CH77 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nav1Q8CH77 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nav1Q8CH77 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nav1Q8CH77 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nav1Q8CH77 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nav1Q8CH77 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nav1Q8CH77 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nav1Q8CH77 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Nav1Q8CH77 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Nav1Q8CH77 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nav1Q8CH77 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nav1Q8CH77 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nav1Q8CH77 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms