Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFT2

Setd1b, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, mousemouse

Predictions only

Length 1,985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd1bQ8CFT2 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Setd1bQ8CFT2 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Setd1bQ8CFT2 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Setd1bQ8CFT2 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Setd1bQ8CFT2 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Setd1bQ8CFT2 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Setd1bQ8CFT2 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Setd1bQ8CFT2 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Setd1bQ8CFT2 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Setd1bQ8CFT2 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Setd1bQ8CFT2 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Setd1bQ8CFT2 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Setd1bQ8CFT2 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Setd1bQ8CFT2 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Setd1bQ8CFT2 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Setd1bQ8CFT2 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Setd1bQ8CFT2 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Setd1bQ8CFT2 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Setd1bQ8CFT2 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Setd1bQ8CFT2 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Setd1bQ8CFT2 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Setd1bQ8CFT2 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Setd1bQ8CFT2 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Setd1bQ8CFT2 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Setd1bQ8CFT2 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Setd1bQ8CFT2 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Setd1bQ8CFT2 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Setd1bQ8CFT2 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Setd1bQ8CFT2 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Setd1bQ8CFT2 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Setd1bQ8CFT2 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Setd1bQ8CFT2 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Setd1bQ8CFT2 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Setd1bQ8CFT2 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Setd1bQ8CFT2 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Setd1bQ8CFT2 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Setd1bQ8CFT2 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Setd1bQ8CFT2 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Setd1bQ8CFT2 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Setd1bQ8CFT2 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Setd1bQ8CFT2 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Setd1bQ8CFT2 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Setd1bQ8CFT2 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Setd1bQ8CFT2 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Setd1bQ8CFT2 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Setd1bQ8CFT2 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Setd1bQ8CFT2 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Setd1bQ8CFT2 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Setd1bQ8CFT2 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Setd1bQ8CFT2 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Setd1bQ8CFT2 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Setd1bQ8CFT2 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Setd1bQ8CFT2 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Setd1bQ8CFT2 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Setd1bQ8CFT2 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Setd1bQ8CFT2 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Setd1bQ8CFT2 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Setd1bQ8CFT2 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Setd1bQ8CFT2 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Setd1bQ8CFT2 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Setd1bQ8CFT2 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Setd1bQ8CFT2 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Setd1bQ8CFT2 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Setd1bQ8CFT2 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Setd1bQ8CFT2 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Setd1bQ8CFT2 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Setd1bQ8CFT2 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Setd1bQ8CFT2 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Setd1bQ8CFT2 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Setd1bQ8CFT2 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Setd1bQ8CFT2 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Setd1bQ8CFT2 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Setd1bQ8CFT2 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Setd1bQ8CFT2 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
Setd1bQ8CFT2 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Setd1bQ8CFT2 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Setd1bQ8CFT2 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Setd1bQ8CFT2 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Setd1bQ8CFT2 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Setd1bQ8CFT2 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Setd1bQ8CFT2 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Setd1bQ8CFT2 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Setd1bQ8CFT2 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Setd1bQ8CFT2 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Setd1bQ8CFT2 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Setd1bQ8CFT2 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Setd1bQ8CFT2 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Setd1bQ8CFT2 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Setd1bQ8CFT2 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Setd1bQ8CFT2 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Setd1bQ8CFT2 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Setd1bQ8CFT2 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Setd1bQ8CFT2 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Setd1bQ8CFT2 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Setd1bQ8CFT2 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Setd1bQ8CFT2 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Setd1bQ8CFT2 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Setd1bQ8CFT2 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Setd1bQ8CFT2 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Setd1bQ8CFT2 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.3 ms