Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cdkl1Q8CEQ0 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cdkl1Q8CEQ0 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdkl1Q8CEQ0 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdkl1Q8CEQ0 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdkl1Q8CEQ0 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cdkl1Q8CEQ0 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdkl1Q8CEQ0 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdkl1Q8CEQ0 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdkl1Q8CEQ0 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdkl1Q8CEQ0 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms