Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC5

Nkiras1, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkiras1Q8CEC5 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nkiras1Q8CEC5 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nkiras1Q8CEC5 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nkiras1Q8CEC5 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nkiras1Q8CEC5 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nkiras1Q8CEC5 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nkiras1Q8CEC5 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nkiras1Q8CEC5 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nkiras1Q8CEC5 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Nkiras1Q8CEC5 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nkiras1Q8CEC5 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nkiras1Q8CEC5 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nkiras1Q8CEC5 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nkiras1Q8CEC5 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nkiras1Q8CEC5 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nkiras1Q8CEC5 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nkiras1Q8CEC5 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nkiras1Q8CEC5 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nkiras1Q8CEC5 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nkiras1Q8CEC5 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nkiras1Q8CEC5 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nkiras1Q8CEC5 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nkiras1Q8CEC5 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nkiras1Q8CEC5 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nkiras1Q8CEC5 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nkiras1Q8CEC5 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nkiras1Q8CEC5 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nkiras1Q8CEC5 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nkiras1Q8CEC5 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nkiras1Q8CEC5 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nkiras1Q8CEC5 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nkiras1Q8CEC5 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nkiras1Q8CEC5 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nkiras1Q8CEC5 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nkiras1Q8CEC5 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nkiras1Q8CEC5 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nkiras1Q8CEC5 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nkiras1Q8CEC5 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nkiras1Q8CEC5 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nkiras1Q8CEC5 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nkiras1Q8CEC5 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nkiras1Q8CEC5 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nkiras1Q8CEC5 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nkiras1Q8CEC5 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nkiras1Q8CEC5 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nkiras1Q8CEC5 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nkiras1Q8CEC5 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nkiras1Q8CEC5 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nkiras1Q8CEC5 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nkiras1Q8CEC5 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nkiras1Q8CEC5 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nkiras1Q8CEC5 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nkiras1Q8CEC5 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nkiras1Q8CEC5 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nkiras1Q8CEC5 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nkiras1Q8CEC5 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nkiras1Q8CEC5 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nkiras1Q8CEC5 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nkiras1Q8CEC5 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nkiras1Q8CEC5 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nkiras1Q8CEC5 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nkiras1Q8CEC5 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nkiras1Q8CEC5 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nkiras1Q8CEC5 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nkiras1Q8CEC5 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nkiras1Q8CEC5 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nkiras1Q8CEC5 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nkiras1Q8CEC5 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nkiras1Q8CEC5 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nkiras1Q8CEC5 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nkiras1Q8CEC5 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nkiras1Q8CEC5 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nkiras1Q8CEC5 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nkiras1Q8CEC5 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nkiras1Q8CEC5 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nkiras1Q8CEC5 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nkiras1Q8CEC5 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nkiras1Q8CEC5 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nkiras1Q8CEC5 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nkiras1Q8CEC5 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nkiras1Q8CEC5 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nkiras1Q8CEC5 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nkiras1Q8CEC5 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nkiras1Q8CEC5 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nkiras1Q8CEC5 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nkiras1Q8CEC5 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nkiras1Q8CEC5 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nkiras1Q8CEC5 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nkiras1Q8CEC5 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nkiras1Q8CEC5 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nkiras1Q8CEC5 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nkiras1Q8CEC5 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nkiras1Q8CEC5 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nkiras1Q8CEC5 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nkiras1Q8CEC5 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nkiras1Q8CEC5 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nkiras1Q8CEC5 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nkiras1Q8CEC5 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nkiras1Q8CEC5 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nkiras1Q8CEC5 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms