Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nhlrc3Q8CCH2 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nhlrc3Q8CCH2 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nhlrc3Q8CCH2 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nhlrc3Q8CCH2 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nhlrc3Q8CCH2 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Nhlrc3Q8CCH2 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nhlrc3Q8CCH2 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nhlrc3Q8CCH2 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nhlrc3Q8CCH2 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nhlrc3Q8CCH2 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Nhlrc3Q8CCH2 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nhlrc3Q8CCH2 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nhlrc3Q8CCH2 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nhlrc3Q8CCH2 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nhlrc3Q8CCH2 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nhlrc3Q8CCH2 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nhlrc3Q8CCH2 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nhlrc3Q8CCH2 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nhlrc3Q8CCH2 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Nhlrc3Q8CCH2 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nhlrc3Q8CCH2 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nhlrc3Q8CCH2 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nhlrc3Q8CCH2 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nhlrc3Q8CCH2 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nhlrc3Q8CCH2 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nhlrc3Q8CCH2 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.07■□□□□ 0
Nhlrc3Q8CCH2 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nhlrc3Q8CCH2 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nhlrc3Q8CCH2 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nhlrc3Q8CCH2 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nhlrc3Q8CCH2 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nhlrc3Q8CCH2 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nhlrc3Q8CCH2 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Nhlrc3Q8CCH2 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nhlrc3Q8CCH2 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nhlrc3Q8CCH2 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nhlrc3Q8CCH2 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nhlrc3Q8CCH2 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nhlrc3Q8CCH2 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nhlrc3Q8CCH2 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nhlrc3Q8CCH2 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nhlrc3Q8CCH2 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nhlrc3Q8CCH2 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nhlrc3Q8CCH2 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nhlrc3Q8CCH2 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nhlrc3Q8CCH2 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nhlrc3Q8CCH2 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nhlrc3Q8CCH2 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nhlrc3Q8CCH2 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nhlrc3Q8CCH2 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nhlrc3Q8CCH2 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Nhlrc3Q8CCH2 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nhlrc3Q8CCH2 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nhlrc3Q8CCH2 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nhlrc3Q8CCH2 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms