Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAT8

Fbxo48, F-box only protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo48Q8CAT8 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fbxo48Q8CAT8 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fbxo48Q8CAT8 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Fbxo48Q8CAT8 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Fbxo48Q8CAT8 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fbxo48Q8CAT8 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fbxo48Q8CAT8 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fbxo48Q8CAT8 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fbxo48Q8CAT8 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fbxo48Q8CAT8 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Fbxo48Q8CAT8 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fbxo48Q8CAT8 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fbxo48Q8CAT8 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Fbxo48Q8CAT8 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fbxo48Q8CAT8 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fbxo48Q8CAT8 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fbxo48Q8CAT8 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fbxo48Q8CAT8 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fbxo48Q8CAT8 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fbxo48Q8CAT8 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fbxo48Q8CAT8 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fbxo48Q8CAT8 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fbxo48Q8CAT8 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fbxo48Q8CAT8 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fbxo48Q8CAT8 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fbxo48Q8CAT8 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fbxo48Q8CAT8 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fbxo48Q8CAT8 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fbxo48Q8CAT8 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fbxo48Q8CAT8 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fbxo48Q8CAT8 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fbxo48Q8CAT8 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fbxo48Q8CAT8 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fbxo48Q8CAT8 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fbxo48Q8CAT8 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Fbxo48Q8CAT8 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fbxo48Q8CAT8 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fbxo48Q8CAT8 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fbxo48Q8CAT8 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fbxo48Q8CAT8 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Fbxo48Q8CAT8 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fbxo48Q8CAT8 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Fbxo48Q8CAT8 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fbxo48Q8CAT8 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fbxo48Q8CAT8 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fbxo48Q8CAT8 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fbxo48Q8CAT8 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Fbxo48Q8CAT8 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fbxo48Q8CAT8 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fbxo48Q8CAT8 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fbxo48Q8CAT8 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fbxo48Q8CAT8 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fbxo48Q8CAT8 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fbxo48Q8CAT8 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Fbxo48Q8CAT8 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fbxo48Q8CAT8 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fbxo48Q8CAT8 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fbxo48Q8CAT8 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fbxo48Q8CAT8 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fbxo48Q8CAT8 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Fbxo48Q8CAT8 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fbxo48Q8CAT8 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fbxo48Q8CAT8 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fbxo48Q8CAT8 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fbxo48Q8CAT8 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fbxo48Q8CAT8 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fbxo48Q8CAT8 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fbxo48Q8CAT8 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fbxo48Q8CAT8 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Fbxo48Q8CAT8 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fbxo48Q8CAT8 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fbxo48Q8CAT8 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fbxo48Q8CAT8 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fbxo48Q8CAT8 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fbxo48Q8CAT8 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fbxo48Q8CAT8 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fbxo48Q8CAT8 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fbxo48Q8CAT8 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fbxo48Q8CAT8 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fbxo48Q8CAT8 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fbxo48Q8CAT8 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fbxo48Q8CAT8 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fbxo48Q8CAT8 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fbxo48Q8CAT8 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fbxo48Q8CAT8 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fbxo48Q8CAT8 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fbxo48Q8CAT8 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fbxo48Q8CAT8 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Fbxo48Q8CAT8 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fbxo48Q8CAT8 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fbxo48Q8CAT8 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fbxo48Q8CAT8 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fbxo48Q8CAT8 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fbxo48Q8CAT8 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Fbxo48Q8CAT8 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Fbxo48Q8CAT8 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Fbxo48Q8CAT8 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Fbxo48Q8CAT8 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Fbxo48Q8CAT8 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fbxo48Q8CAT8 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms