Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6A8

Bhlhe22, Class E basic helix-loop-helix protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe22Q8C6A8 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Bhlhe22Q8C6A8 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Bhlhe22Q8C6A8 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Bhlhe22Q8C6A8 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Bhlhe22Q8C6A8 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Bhlhe22Q8C6A8 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Bhlhe22Q8C6A8 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Bhlhe22Q8C6A8 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Bhlhe22Q8C6A8 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Bhlhe22Q8C6A8 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Bhlhe22Q8C6A8 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Bhlhe22Q8C6A8 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Bhlhe22Q8C6A8 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Bhlhe22Q8C6A8 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Bhlhe22Q8C6A8 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Bhlhe22Q8C6A8 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Bhlhe22Q8C6A8 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Bhlhe22Q8C6A8 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Bhlhe22Q8C6A8 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Bhlhe22Q8C6A8 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Bhlhe22Q8C6A8 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Bhlhe22Q8C6A8 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Bhlhe22Q8C6A8 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Bhlhe22Q8C6A8 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Bhlhe22Q8C6A8 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Bhlhe22Q8C6A8 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Bhlhe22Q8C6A8 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Bhlhe22Q8C6A8 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Bhlhe22Q8C6A8 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Bhlhe22Q8C6A8 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Bhlhe22Q8C6A8 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Bhlhe22Q8C6A8 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Bhlhe22Q8C6A8 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Bhlhe22Q8C6A8 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Bhlhe22Q8C6A8 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Bhlhe22Q8C6A8 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Bhlhe22Q8C6A8 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Bhlhe22Q8C6A8 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Bhlhe22Q8C6A8 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Bhlhe22Q8C6A8 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Bhlhe22Q8C6A8 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Bhlhe22Q8C6A8 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Bhlhe22Q8C6A8 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Bhlhe22Q8C6A8 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Bhlhe22Q8C6A8 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Bhlhe22Q8C6A8 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Bhlhe22Q8C6A8 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Bhlhe22Q8C6A8 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Bhlhe22Q8C6A8 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Bhlhe22Q8C6A8 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Bhlhe22Q8C6A8 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Bhlhe22Q8C6A8 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Bhlhe22Q8C6A8 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Bhlhe22Q8C6A8 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Bhlhe22Q8C6A8 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Bhlhe22Q8C6A8 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Bhlhe22Q8C6A8 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Bhlhe22Q8C6A8 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Bhlhe22Q8C6A8 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Bhlhe22Q8C6A8 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Bhlhe22Q8C6A8 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Bhlhe22Q8C6A8 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Bhlhe22Q8C6A8 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Bhlhe22Q8C6A8 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Bhlhe22Q8C6A8 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Bhlhe22Q8C6A8 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Bhlhe22Q8C6A8 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Bhlhe22Q8C6A8 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Bhlhe22Q8C6A8 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Bhlhe22Q8C6A8 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Bhlhe22Q8C6A8 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Bhlhe22Q8C6A8 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Bhlhe22Q8C6A8 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Bhlhe22Q8C6A8 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Bhlhe22Q8C6A8 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Bhlhe22Q8C6A8 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Bhlhe22Q8C6A8 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Bhlhe22Q8C6A8 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Bhlhe22Q8C6A8 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Bhlhe22Q8C6A8 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Bhlhe22Q8C6A8 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Bhlhe22Q8C6A8 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Bhlhe22Q8C6A8 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Bhlhe22Q8C6A8 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Bhlhe22Q8C6A8 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Bhlhe22Q8C6A8 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Bhlhe22Q8C6A8 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Bhlhe22Q8C6A8 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Bhlhe22Q8C6A8 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Bhlhe22Q8C6A8 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Bhlhe22Q8C6A8 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Bhlhe22Q8C6A8 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Bhlhe22Q8C6A8 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Bhlhe22Q8C6A8 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Bhlhe22Q8C6A8 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Bhlhe22Q8C6A8 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Bhlhe22Q8C6A8 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Bhlhe22Q8C6A8 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Bhlhe22Q8C6A8 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Bhlhe22Q8C6A8 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms