Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

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Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp38Q8BW70 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp38Q8BW70 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp38Q8BW70 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp38Q8BW70 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Usp38Q8BW70 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Usp38Q8BW70 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Usp38Q8BW70 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Usp38Q8BW70 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Usp38Q8BW70 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Usp38Q8BW70 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Usp38Q8BW70 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Usp38Q8BW70 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Usp38Q8BW70 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Usp38Q8BW70 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Usp38Q8BW70 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Usp38Q8BW70 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Usp38Q8BW70 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Usp38Q8BW70 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Usp38Q8BW70 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Usp38Q8BW70 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Usp38Q8BW70 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Usp38Q8BW70 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Usp38Q8BW70 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Usp38Q8BW70 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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Usp38Q8BW70 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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Usp38Q8BW70 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Usp38Q8BW70 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Usp38Q8BW70 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Usp38Q8BW70 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Usp38Q8BW70 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Usp38Q8BW70 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Usp38Q8BW70 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Usp38Q8BW70 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Usp38Q8BW70 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Usp38Q8BW70 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Usp38Q8BW70 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Usp38Q8BW70 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Usp38Q8BW70 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
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Usp38Q8BW70 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Usp38Q8BW70 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
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Usp38Q8BW70 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
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Usp38Q8BW70 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
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Usp38Q8BW70 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Usp38Q8BW70 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Usp38Q8BW70 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
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Usp38Q8BW70 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Usp38Q8BW70 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Usp38Q8BW70 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Usp38Q8BW70 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Usp38Q8BW70 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Usp38Q8BW70 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Usp38Q8BW70 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Usp38Q8BW70 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Usp38Q8BW70 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Usp38Q8BW70 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Usp38Q8BW70 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Usp38Q8BW70 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Usp38Q8BW70 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Usp38Q8BW70 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Usp38Q8BW70 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Usp38Q8BW70 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Usp38Q8BW70 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Usp38Q8BW70 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Usp38Q8BW70 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Usp38Q8BW70 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Usp38Q8BW70 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
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