Protein–RNA interactions for Protein: Q8BU27

Ppm1m, Protein phosphatase 1M, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppm1mQ8BU27 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppm1mQ8BU27 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppm1mQ8BU27 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppm1mQ8BU27 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppm1mQ8BU27 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppm1mQ8BU27 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppm1mQ8BU27 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppm1mQ8BU27 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppm1mQ8BU27 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppm1mQ8BU27 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppm1mQ8BU27 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppm1mQ8BU27 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppm1mQ8BU27 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppm1mQ8BU27 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppm1mQ8BU27 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppm1mQ8BU27 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppm1mQ8BU27 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppm1mQ8BU27 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppm1mQ8BU27 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppm1mQ8BU27 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppm1mQ8BU27 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppm1mQ8BU27 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppm1mQ8BU27 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppm1mQ8BU27 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppm1mQ8BU27 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppm1mQ8BU27 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppm1mQ8BU27 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppm1mQ8BU27 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppm1mQ8BU27 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppm1mQ8BU27 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppm1mQ8BU27 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppm1mQ8BU27 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppm1mQ8BU27 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppm1mQ8BU27 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppm1mQ8BU27 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppm1mQ8BU27 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppm1mQ8BU27 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppm1mQ8BU27 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppm1mQ8BU27 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppm1mQ8BU27 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppm1mQ8BU27 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppm1mQ8BU27 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppm1mQ8BU27 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppm1mQ8BU27 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppm1mQ8BU27 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppm1mQ8BU27 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppm1mQ8BU27 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppm1mQ8BU27 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppm1mQ8BU27 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppm1mQ8BU27 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppm1mQ8BU27 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppm1mQ8BU27 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppm1mQ8BU27 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ppm1mQ8BU27 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ppm1mQ8BU27 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ppm1mQ8BU27 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ppm1mQ8BU27 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ppm1mQ8BU27 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ppm1mQ8BU27 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ppm1mQ8BU27 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ppm1mQ8BU27 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ppm1mQ8BU27 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ppm1mQ8BU27 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ppm1mQ8BU27 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ppm1mQ8BU27 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ppm1mQ8BU27 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ppm1mQ8BU27 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ppm1mQ8BU27 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ppm1mQ8BU27 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ppm1mQ8BU27 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ppm1mQ8BU27 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ppm1mQ8BU27 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppm1mQ8BU27 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppm1mQ8BU27 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppm1mQ8BU27 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppm1mQ8BU27 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppm1mQ8BU27 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppm1mQ8BU27 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppm1mQ8BU27 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppm1mQ8BU27 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppm1mQ8BU27 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppm1mQ8BU27 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppm1mQ8BU27 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppm1mQ8BU27 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppm1mQ8BU27 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppm1mQ8BU27 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppm1mQ8BU27 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppm1mQ8BU27 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppm1mQ8BU27 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppm1mQ8BU27 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppm1mQ8BU27 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppm1mQ8BU27 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppm1mQ8BU27 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppm1mQ8BU27 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppm1mQ8BU27 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppm1mQ8BU27 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppm1mQ8BU27 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppm1mQ8BU27 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppm1mQ8BU27 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppm1mQ8BU27 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms