Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTQ0

PcgF3, Polycomb group RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcgF3Q8BTQ0 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PcgF3Q8BTQ0 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PcgF3Q8BTQ0 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PcgF3Q8BTQ0 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PcgF3Q8BTQ0 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PcgF3Q8BTQ0 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PcgF3Q8BTQ0 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PcgF3Q8BTQ0 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PcgF3Q8BTQ0 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PcgF3Q8BTQ0 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PcgF3Q8BTQ0 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PcgF3Q8BTQ0 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PcgF3Q8BTQ0 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PcgF3Q8BTQ0 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PcgF3Q8BTQ0 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PcgF3Q8BTQ0 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PcgF3Q8BTQ0 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PcgF3Q8BTQ0 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PcgF3Q8BTQ0 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PcgF3Q8BTQ0 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PcgF3Q8BTQ0 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PcgF3Q8BTQ0 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PcgF3Q8BTQ0 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PcgF3Q8BTQ0 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PcgF3Q8BTQ0 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PcgF3Q8BTQ0 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PcgF3Q8BTQ0 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PcgF3Q8BTQ0 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PcgF3Q8BTQ0 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PcgF3Q8BTQ0 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PcgF3Q8BTQ0 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PcgF3Q8BTQ0 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PcgF3Q8BTQ0 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PcgF3Q8BTQ0 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PcgF3Q8BTQ0 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PcgF3Q8BTQ0 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PcgF3Q8BTQ0 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PcgF3Q8BTQ0 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PcgF3Q8BTQ0 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PcgF3Q8BTQ0 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PcgF3Q8BTQ0 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PcgF3Q8BTQ0 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PcgF3Q8BTQ0 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PcgF3Q8BTQ0 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PcgF3Q8BTQ0 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PcgF3Q8BTQ0 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PcgF3Q8BTQ0 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PcgF3Q8BTQ0 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PcgF3Q8BTQ0 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PcgF3Q8BTQ0 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PcgF3Q8BTQ0 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PcgF3Q8BTQ0 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PcgF3Q8BTQ0 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PcgF3Q8BTQ0 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PcgF3Q8BTQ0 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PcgF3Q8BTQ0 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PcgF3Q8BTQ0 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PcgF3Q8BTQ0 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PcgF3Q8BTQ0 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PcgF3Q8BTQ0 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PcgF3Q8BTQ0 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PcgF3Q8BTQ0 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PcgF3Q8BTQ0 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PcgF3Q8BTQ0 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PcgF3Q8BTQ0 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PcgF3Q8BTQ0 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PcgF3Q8BTQ0 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PcgF3Q8BTQ0 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PcgF3Q8BTQ0 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PcgF3Q8BTQ0 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PcgF3Q8BTQ0 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PcgF3Q8BTQ0 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PcgF3Q8BTQ0 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PcgF3Q8BTQ0 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PcgF3Q8BTQ0 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PcgF3Q8BTQ0 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PcgF3Q8BTQ0 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PcgF3Q8BTQ0 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PcgF3Q8BTQ0 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PcgF3Q8BTQ0 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PcgF3Q8BTQ0 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PcgF3Q8BTQ0 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PcgF3Q8BTQ0 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PcgF3Q8BTQ0 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PcgF3Q8BTQ0 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PcgF3Q8BTQ0 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PcgF3Q8BTQ0 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PcgF3Q8BTQ0 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PcgF3Q8BTQ0 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PcgF3Q8BTQ0 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PcgF3Q8BTQ0 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PcgF3Q8BTQ0 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PcgF3Q8BTQ0 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PcgF3Q8BTQ0 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PcgF3Q8BTQ0 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PcgF3Q8BTQ0 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PcgF3Q8BTQ0 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PcgF3Q8BTQ0 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PcgF3Q8BTQ0 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PcgF3Q8BTQ0 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms