Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMG7

Rab3gap2, Rab3 GTPase-activating protein non-catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3gap2Q8BMG7 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rab3gap2Q8BMG7 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rab3gap2Q8BMG7 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rab3gap2Q8BMG7 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rab3gap2Q8BMG7 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rab3gap2Q8BMG7 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rab3gap2Q8BMG7 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rab3gap2Q8BMG7 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Rab3gap2Q8BMG7 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rab3gap2Q8BMG7 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rab3gap2Q8BMG7 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rab3gap2Q8BMG7 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rab3gap2Q8BMG7 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rab3gap2Q8BMG7 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rab3gap2Q8BMG7 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rab3gap2Q8BMG7 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rab3gap2Q8BMG7 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rab3gap2Q8BMG7 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Rab3gap2Q8BMG7 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rab3gap2Q8BMG7 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rab3gap2Q8BMG7 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rab3gap2Q8BMG7 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rab3gap2Q8BMG7 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rab3gap2Q8BMG7 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rab3gap2Q8BMG7 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rab3gap2Q8BMG7 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rab3gap2Q8BMG7 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rab3gap2Q8BMG7 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Rab3gap2Q8BMG7 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rab3gap2Q8BMG7 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rab3gap2Q8BMG7 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rab3gap2Q8BMG7 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rab3gap2Q8BMG7 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rab3gap2Q8BMG7 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rab3gap2Q8BMG7 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rab3gap2Q8BMG7 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rab3gap2Q8BMG7 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rab3gap2Q8BMG7 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rab3gap2Q8BMG7 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rab3gap2Q8BMG7 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rab3gap2Q8BMG7 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rab3gap2Q8BMG7 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rab3gap2Q8BMG7 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Rab3gap2Q8BMG7 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rab3gap2Q8BMG7 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rab3gap2Q8BMG7 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rab3gap2Q8BMG7 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Rab3gap2Q8BMG7 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rab3gap2Q8BMG7 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Rab3gap2Q8BMG7 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rab3gap2Q8BMG7 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rab3gap2Q8BMG7 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rab3gap2Q8BMG7 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rab3gap2Q8BMG7 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rab3gap2Q8BMG7 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rab3gap2Q8BMG7 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rab3gap2Q8BMG7 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rab3gap2Q8BMG7 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rab3gap2Q8BMG7 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rab3gap2Q8BMG7 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rab3gap2Q8BMG7 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rab3gap2Q8BMG7 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rab3gap2Q8BMG7 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rab3gap2Q8BMG7 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rab3gap2Q8BMG7 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rab3gap2Q8BMG7 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rab3gap2Q8BMG7 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rab3gap2Q8BMG7 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rab3gap2Q8BMG7 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rab3gap2Q8BMG7 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rab3gap2Q8BMG7 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rab3gap2Q8BMG7 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rab3gap2Q8BMG7 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rab3gap2Q8BMG7 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rab3gap2Q8BMG7 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rab3gap2Q8BMG7 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rab3gap2Q8BMG7 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rab3gap2Q8BMG7 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rab3gap2Q8BMG7 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rab3gap2Q8BMG7 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rab3gap2Q8BMG7 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Rab3gap2Q8BMG7 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rab3gap2Q8BMG7 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rab3gap2Q8BMG7 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rab3gap2Q8BMG7 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rab3gap2Q8BMG7 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Rab3gap2Q8BMG7 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Rab3gap2Q8BMG7 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rab3gap2Q8BMG7 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rab3gap2Q8BMG7 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rab3gap2Q8BMG7 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rab3gap2Q8BMG7 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rab3gap2Q8BMG7 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rab3gap2Q8BMG7 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rab3gap2Q8BMG7 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rab3gap2Q8BMG7 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rab3gap2Q8BMG7 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rab3gap2Q8BMG7 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rab3gap2Q8BMG7 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rab3gap2Q8BMG7 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms