Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-M10.4Q85ZW8 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-M10.4Q85ZW8 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-M10.4Q85ZW8 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-M10.4Q85ZW8 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-M10.4Q85ZW8 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-M10.4Q85ZW8 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-M10.4Q85ZW8 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms