Protein–RNA interactions for Protein: Q80U49

Cep170b, Centrosomal protein of 170 kDa protein B, mousemouse

Predictions only

Length 1,574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep170bQ80U49 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cep170bQ80U49 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cep170bQ80U49 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cep170bQ80U49 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cep170bQ80U49 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cep170bQ80U49 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Cep170bQ80U49 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cep170bQ80U49 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cep170bQ80U49 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cep170bQ80U49 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cep170bQ80U49 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cep170bQ80U49 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cep170bQ80U49 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cep170bQ80U49 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cep170bQ80U49 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cep170bQ80U49 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cep170bQ80U49 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cep170bQ80U49 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cep170bQ80U49 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cep170bQ80U49 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Cep170bQ80U49 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Cep170bQ80U49 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cep170bQ80U49 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cep170bQ80U49 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Cep170bQ80U49 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cep170bQ80U49 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cep170bQ80U49 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cep170bQ80U49 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cep170bQ80U49 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cep170bQ80U49 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cep170bQ80U49 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cep170bQ80U49 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cep170bQ80U49 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cep170bQ80U49 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cep170bQ80U49 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cep170bQ80U49 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cep170bQ80U49 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cep170bQ80U49 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cep170bQ80U49 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cep170bQ80U49 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cep170bQ80U49 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cep170bQ80U49 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cep170bQ80U49 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cep170bQ80U49 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cep170bQ80U49 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cep170bQ80U49 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cep170bQ80U49 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cep170bQ80U49 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cep170bQ80U49 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cep170bQ80U49 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cep170bQ80U49 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cep170bQ80U49 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cep170bQ80U49 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cep170bQ80U49 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cep170bQ80U49 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cep170bQ80U49 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cep170bQ80U49 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cep170bQ80U49 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cep170bQ80U49 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cep170bQ80U49 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cep170bQ80U49 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cep170bQ80U49 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cep170bQ80U49 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cep170bQ80U49 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cep170bQ80U49 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Cep170bQ80U49 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cep170bQ80U49 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cep170bQ80U49 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cep170bQ80U49 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cep170bQ80U49 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cep170bQ80U49 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cep170bQ80U49 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cep170bQ80U49 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cep170bQ80U49 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cep170bQ80U49 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cep170bQ80U49 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Cep170bQ80U49 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cep170bQ80U49 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cep170bQ80U49 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cep170bQ80U49 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cep170bQ80U49 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cep170bQ80U49 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cep170bQ80U49 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cep170bQ80U49 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cep170bQ80U49 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cep170bQ80U49 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cep170bQ80U49 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cep170bQ80U49 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cep170bQ80U49 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Cep170bQ80U49 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Cep170bQ80U49 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Cep170bQ80U49 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Cep170bQ80U49 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Cep170bQ80U49 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cep170bQ80U49 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cep170bQ80U49 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cep170bQ80U49 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cep170bQ80U49 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Cep170bQ80U49 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cep170bQ80U49 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms