Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
NischQ80TM9 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC37.73■■■■□ 3.63
NischQ80TM9 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
NischQ80TM9 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
NischQ80TM9 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC37.73■■■■□ 3.63
NischQ80TM9 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
NischQ80TM9 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
NischQ80TM9 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
NischQ80TM9 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
NischQ80TM9 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
NischQ80TM9 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
NischQ80TM9 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
NischQ80TM9 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.72■■■■□ 3.63
NischQ80TM9 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
NischQ80TM9 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC37.72■■■■□ 3.63
NischQ80TM9 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC37.72■■■■□ 3.63
NischQ80TM9 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC37.72■■■■□ 3.63
NischQ80TM9 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
NischQ80TM9 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC37.71■■■■□ 3.63
NischQ80TM9 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
NischQ80TM9 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
NischQ80TM9 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.7■■■■□ 3.63
NischQ80TM9 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
NischQ80TM9 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
NischQ80TM9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
NischQ80TM9 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
NischQ80TM9 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.7■■■■□ 3.62
NischQ80TM9 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
NischQ80TM9 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
NischQ80TM9 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
NischQ80TM9 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC37.68■■■■□ 3.62
NischQ80TM9 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC37.68■■■■□ 3.62
NischQ80TM9 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
NischQ80TM9 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
NischQ80TM9 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
NischQ80TM9 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
NischQ80TM9 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
NischQ80TM9 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
NischQ80TM9 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
NischQ80TM9 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC37.67■■■■□ 3.62
NischQ80TM9 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
NischQ80TM9 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
NischQ80TM9 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
NischQ80TM9 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC37.66■■■■□ 3.62
NischQ80TM9 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC37.66■■■■□ 3.62
NischQ80TM9 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
NischQ80TM9 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC37.66■■■■□ 3.62
NischQ80TM9 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC37.66■■■■□ 3.62
NischQ80TM9 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
NischQ80TM9 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
NischQ80TM9 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
NischQ80TM9 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
NischQ80TM9 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.65■■■■□ 3.62
NischQ80TM9 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
NischQ80TM9 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
NischQ80TM9 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.64■■■■□ 3.62
NischQ80TM9 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
NischQ80TM9 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC37.63■■■■□ 3.62
NischQ80TM9 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.62
NischQ80TM9 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.63■■■■□ 3.61
NischQ80TM9 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
NischQ80TM9 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC37.63■■■■□ 3.61
NischQ80TM9 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
NischQ80TM9 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
NischQ80TM9 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
NischQ80TM9 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.62■■■■□ 3.61
NischQ80TM9 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.62■■■■□ 3.61
NischQ80TM9 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
NischQ80TM9 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
NischQ80TM9 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
NischQ80TM9 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC37.62■■■■□ 3.61
NischQ80TM9 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
NischQ80TM9 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC37.61■■■■□ 3.61
NischQ80TM9 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.61■■■■□ 3.61
NischQ80TM9 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC37.61■■■■□ 3.61
NischQ80TM9 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC37.61■■■■□ 3.61
NischQ80TM9 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC37.61■■■■□ 3.61
NischQ80TM9 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
NischQ80TM9 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC37.61■■■■□ 3.61
NischQ80TM9 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
NischQ80TM9 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
NischQ80TM9 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
NischQ80TM9 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
NischQ80TM9 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
NischQ80TM9 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
NischQ80TM9 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.59■■■■□ 3.61
NischQ80TM9 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
NischQ80TM9 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
NischQ80TM9 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
NischQ80TM9 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC37.59■■■■□ 3.61
NischQ80TM9 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC37.59■■■■□ 3.61
NischQ80TM9 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.59■■■■□ 3.61
NischQ80TM9 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC37.58■■■■□ 3.61
NischQ80TM9 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC37.58■■■■□ 3.61
NischQ80TM9 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
NischQ80TM9 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC37.57■■■■□ 3.6
NischQ80TM9 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.57■■■■□ 3.6
NischQ80TM9 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
NischQ80TM9 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
NischQ80TM9 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
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