Protein–RNA interactions for Protein: Q80TE0

Rpap1, RNA polymerase II-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpap1Q80TE0 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Rpap1Q80TE0 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Rpap1Q80TE0 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Rpap1Q80TE0 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rpap1Q80TE0 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rpap1Q80TE0 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rpap1Q80TE0 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rpap1Q80TE0 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rpap1Q80TE0 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rpap1Q80TE0 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rpap1Q80TE0 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rpap1Q80TE0 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rpap1Q80TE0 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rpap1Q80TE0 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rpap1Q80TE0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rpap1Q80TE0 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rpap1Q80TE0 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rpap1Q80TE0 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Rpap1Q80TE0 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Rpap1Q80TE0 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rpap1Q80TE0 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rpap1Q80TE0 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rpap1Q80TE0 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rpap1Q80TE0 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Rpap1Q80TE0 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Rpap1Q80TE0 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rpap1Q80TE0 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rpap1Q80TE0 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rpap1Q80TE0 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rpap1Q80TE0 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Rpap1Q80TE0 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Rpap1Q80TE0 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rpap1Q80TE0 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rpap1Q80TE0 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rpap1Q80TE0 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rpap1Q80TE0 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rpap1Q80TE0 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rpap1Q80TE0 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rpap1Q80TE0 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rpap1Q80TE0 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Rpap1Q80TE0 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Rpap1Q80TE0 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rpap1Q80TE0 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rpap1Q80TE0 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rpap1Q80TE0 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rpap1Q80TE0 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rpap1Q80TE0 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rpap1Q80TE0 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rpap1Q80TE0 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rpap1Q80TE0 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rpap1Q80TE0 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rpap1Q80TE0 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rpap1Q80TE0 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Rpap1Q80TE0 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Rpap1Q80TE0 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Rpap1Q80TE0 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Rpap1Q80TE0 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Rpap1Q80TE0 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Rpap1Q80TE0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rpap1Q80TE0 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rpap1Q80TE0 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Rpap1Q80TE0 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rpap1Q80TE0 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rpap1Q80TE0 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rpap1Q80TE0 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rpap1Q80TE0 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rpap1Q80TE0 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rpap1Q80TE0 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rpap1Q80TE0 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rpap1Q80TE0 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rpap1Q80TE0 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Rpap1Q80TE0 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rpap1Q80TE0 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rpap1Q80TE0 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rpap1Q80TE0 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rpap1Q80TE0 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rpap1Q80TE0 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rpap1Q80TE0 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Rpap1Q80TE0 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rpap1Q80TE0 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rpap1Q80TE0 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rpap1Q80TE0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rpap1Q80TE0 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rpap1Q80TE0 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rpap1Q80TE0 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rpap1Q80TE0 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Rpap1Q80TE0 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rpap1Q80TE0 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Rpap1Q80TE0 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rpap1Q80TE0 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Rpap1Q80TE0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rpap1Q80TE0 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rpap1Q80TE0 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rpap1Q80TE0 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rpap1Q80TE0 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rpap1Q80TE0 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rpap1Q80TE0 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rpap1Q80TE0 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rpap1Q80TE0 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rpap1Q80TE0 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms