Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT50

Cdc42bpb, Serine/threonine-protein kinase MRCK beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42bpbQ7TT50 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cdc42bpbQ7TT50 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cdc42bpbQ7TT50 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Cdc42bpbQ7TT50 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Cdc42bpbQ7TT50 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Cdc42bpbQ7TT50 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cdc42bpbQ7TT50 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cdc42bpbQ7TT50 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cdc42bpbQ7TT50 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cdc42bpbQ7TT50 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cdc42bpbQ7TT50 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cdc42bpbQ7TT50 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Cdc42bpbQ7TT50 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Cdc42bpbQ7TT50 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Cdc42bpbQ7TT50 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cdc42bpbQ7TT50 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cdc42bpbQ7TT50 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cdc42bpbQ7TT50 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cdc42bpbQ7TT50 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cdc42bpbQ7TT50 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cdc42bpbQ7TT50 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cdc42bpbQ7TT50 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cdc42bpbQ7TT50 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cdc42bpbQ7TT50 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cdc42bpbQ7TT50 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cdc42bpbQ7TT50 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cdc42bpbQ7TT50 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.76
Cdc42bpbQ7TT50 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Cdc42bpbQ7TT50 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
Cdc42bpbQ7TT50 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Cdc42bpbQ7TT50 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cdc42bpbQ7TT50 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cdc42bpbQ7TT50 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cdc42bpbQ7TT50 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cdc42bpbQ7TT50 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cdc42bpbQ7TT50 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cdc42bpbQ7TT50 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cdc42bpbQ7TT50 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Cdc42bpbQ7TT50 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Cdc42bpbQ7TT50 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cdc42bpbQ7TT50 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cdc42bpbQ7TT50 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cdc42bpbQ7TT50 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cdc42bpbQ7TT50 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cdc42bpbQ7TT50 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cdc42bpbQ7TT50 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cdc42bpbQ7TT50 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cdc42bpbQ7TT50 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cdc42bpbQ7TT50 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cdc42bpbQ7TT50 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cdc42bpbQ7TT50 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cdc42bpbQ7TT50 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cdc42bpbQ7TT50 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cdc42bpbQ7TT50 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Cdc42bpbQ7TT50 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Cdc42bpbQ7TT50 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cdc42bpbQ7TT50 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cdc42bpbQ7TT50 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cdc42bpbQ7TT50 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cdc42bpbQ7TT50 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cdc42bpbQ7TT50 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cdc42bpbQ7TT50 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cdc42bpbQ7TT50 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cdc42bpbQ7TT50 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Cdc42bpbQ7TT50 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cdc42bpbQ7TT50 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cdc42bpbQ7TT50 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cdc42bpbQ7TT50 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cdc42bpbQ7TT50 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cdc42bpbQ7TT50 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cdc42bpbQ7TT50 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cdc42bpbQ7TT50 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cdc42bpbQ7TT50 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cdc42bpbQ7TT50 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cdc42bpbQ7TT50 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cdc42bpbQ7TT50 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cdc42bpbQ7TT50 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cdc42bpbQ7TT50 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cdc42bpbQ7TT50 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cdc42bpbQ7TT50 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cdc42bpbQ7TT50 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cdc42bpbQ7TT50 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cdc42bpbQ7TT50 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cdc42bpbQ7TT50 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cdc42bpbQ7TT50 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cdc42bpbQ7TT50 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cdc42bpbQ7TT50 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cdc42bpbQ7TT50 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cdc42bpbQ7TT50 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Cdc42bpbQ7TT50 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cdc42bpbQ7TT50 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cdc42bpbQ7TT50 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Cdc42bpbQ7TT50 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cdc42bpbQ7TT50 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Cdc42bpbQ7TT50 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cdc42bpbQ7TT50 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cdc42bpbQ7TT50 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Cdc42bpbQ7TT50 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cdc42bpbQ7TT50 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Cdc42bpbQ7TT50 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms