Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSY8

Sgo2, Shugoshin 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,164 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo2Q7TSY8 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sgo2Q7TSY8 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sgo2Q7TSY8 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sgo2Q7TSY8 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sgo2Q7TSY8 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sgo2Q7TSY8 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sgo2Q7TSY8 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sgo2Q7TSY8 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sgo2Q7TSY8 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sgo2Q7TSY8 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sgo2Q7TSY8 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sgo2Q7TSY8 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sgo2Q7TSY8 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sgo2Q7TSY8 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sgo2Q7TSY8 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sgo2Q7TSY8 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sgo2Q7TSY8 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sgo2Q7TSY8 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sgo2Q7TSY8 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sgo2Q7TSY8 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sgo2Q7TSY8 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sgo2Q7TSY8 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sgo2Q7TSY8 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sgo2Q7TSY8 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sgo2Q7TSY8 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sgo2Q7TSY8 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sgo2Q7TSY8 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sgo2Q7TSY8 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sgo2Q7TSY8 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sgo2Q7TSY8 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sgo2Q7TSY8 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sgo2Q7TSY8 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sgo2Q7TSY8 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sgo2Q7TSY8 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sgo2Q7TSY8 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sgo2Q7TSY8 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sgo2Q7TSY8 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sgo2Q7TSY8 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sgo2Q7TSY8 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sgo2Q7TSY8 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sgo2Q7TSY8 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sgo2Q7TSY8 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Sgo2Q7TSY8 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sgo2Q7TSY8 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sgo2Q7TSY8 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sgo2Q7TSY8 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Sgo2Q7TSY8 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sgo2Q7TSY8 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sgo2Q7TSY8 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sgo2Q7TSY8 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sgo2Q7TSY8 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sgo2Q7TSY8 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sgo2Q7TSY8 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sgo2Q7TSY8 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sgo2Q7TSY8 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sgo2Q7TSY8 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Sgo2Q7TSY8 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Sgo2Q7TSY8 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sgo2Q7TSY8 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sgo2Q7TSY8 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sgo2Q7TSY8 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sgo2Q7TSY8 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sgo2Q7TSY8 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sgo2Q7TSY8 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Sgo2Q7TSY8 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sgo2Q7TSY8 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sgo2Q7TSY8 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sgo2Q7TSY8 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sgo2Q7TSY8 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sgo2Q7TSY8 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sgo2Q7TSY8 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sgo2Q7TSY8 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sgo2Q7TSY8 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sgo2Q7TSY8 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sgo2Q7TSY8 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sgo2Q7TSY8 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sgo2Q7TSY8 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sgo2Q7TSY8 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sgo2Q7TSY8 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sgo2Q7TSY8 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Sgo2Q7TSY8 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sgo2Q7TSY8 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sgo2Q7TSY8 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sgo2Q7TSY8 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sgo2Q7TSY8 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sgo2Q7TSY8 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sgo2Q7TSY8 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sgo2Q7TSY8 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Sgo2Q7TSY8 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sgo2Q7TSY8 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sgo2Q7TSY8 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sgo2Q7TSY8 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Sgo2Q7TSY8 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Sgo2Q7TSY8 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sgo2Q7TSY8 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sgo2Q7TSY8 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sgo2Q7TSY8 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sgo2Q7TSY8 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sgo2Q7TSY8 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sgo2Q7TSY8 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 6.9 ms