Protein–RNA interactions for Protein: Q7TST5

Lamp3, Lysosome-associated membrane glycoprotein 3, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp3Q7TST5 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lamp3Q7TST5 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lamp3Q7TST5 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lamp3Q7TST5 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lamp3Q7TST5 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lamp3Q7TST5 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lamp3Q7TST5 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lamp3Q7TST5 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lamp3Q7TST5 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lamp3Q7TST5 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lamp3Q7TST5 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lamp3Q7TST5 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lamp3Q7TST5 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lamp3Q7TST5 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lamp3Q7TST5 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Lamp3Q7TST5 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Lamp3Q7TST5 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Lamp3Q7TST5 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Lamp3Q7TST5 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lamp3Q7TST5 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lamp3Q7TST5 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lamp3Q7TST5 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lamp3Q7TST5 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lamp3Q7TST5 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lamp3Q7TST5 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lamp3Q7TST5 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lamp3Q7TST5 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lamp3Q7TST5 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lamp3Q7TST5 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lamp3Q7TST5 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lamp3Q7TST5 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lamp3Q7TST5 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lamp3Q7TST5 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lamp3Q7TST5 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lamp3Q7TST5 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Lamp3Q7TST5 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lamp3Q7TST5 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lamp3Q7TST5 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Lamp3Q7TST5 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lamp3Q7TST5 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lamp3Q7TST5 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lamp3Q7TST5 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lamp3Q7TST5 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lamp3Q7TST5 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lamp3Q7TST5 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lamp3Q7TST5 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lamp3Q7TST5 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lamp3Q7TST5 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lamp3Q7TST5 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lamp3Q7TST5 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lamp3Q7TST5 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lamp3Q7TST5 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lamp3Q7TST5 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lamp3Q7TST5 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lamp3Q7TST5 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lamp3Q7TST5 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lamp3Q7TST5 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lamp3Q7TST5 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lamp3Q7TST5 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lamp3Q7TST5 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lamp3Q7TST5 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lamp3Q7TST5 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lamp3Q7TST5 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lamp3Q7TST5 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lamp3Q7TST5 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lamp3Q7TST5 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lamp3Q7TST5 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Lamp3Q7TST5 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lamp3Q7TST5 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lamp3Q7TST5 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lamp3Q7TST5 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lamp3Q7TST5 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lamp3Q7TST5 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lamp3Q7TST5 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Lamp3Q7TST5 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lamp3Q7TST5 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lamp3Q7TST5 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lamp3Q7TST5 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lamp3Q7TST5 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lamp3Q7TST5 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lamp3Q7TST5 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lamp3Q7TST5 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lamp3Q7TST5 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lamp3Q7TST5 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lamp3Q7TST5 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lamp3Q7TST5 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lamp3Q7TST5 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lamp3Q7TST5 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lamp3Q7TST5 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lamp3Q7TST5 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lamp3Q7TST5 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lamp3Q7TST5 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lamp3Q7TST5 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lamp3Q7TST5 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lamp3Q7TST5 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lamp3Q7TST5 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lamp3Q7TST5 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lamp3Q7TST5 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lamp3Q7TST5 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lamp3Q7TST5 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms