Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMX5

Shq1, Protein SHQ1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shq1Q7TMX5 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Shq1Q7TMX5 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Shq1Q7TMX5 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Shq1Q7TMX5 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Shq1Q7TMX5 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Shq1Q7TMX5 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Shq1Q7TMX5 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Shq1Q7TMX5 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Shq1Q7TMX5 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Shq1Q7TMX5 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Shq1Q7TMX5 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Shq1Q7TMX5 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Shq1Q7TMX5 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Shq1Q7TMX5 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Shq1Q7TMX5 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Shq1Q7TMX5 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Shq1Q7TMX5 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Shq1Q7TMX5 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Shq1Q7TMX5 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Shq1Q7TMX5 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Shq1Q7TMX5 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Shq1Q7TMX5 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Shq1Q7TMX5 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Shq1Q7TMX5 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Shq1Q7TMX5 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Shq1Q7TMX5 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Shq1Q7TMX5 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Shq1Q7TMX5 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Shq1Q7TMX5 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Shq1Q7TMX5 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Shq1Q7TMX5 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Shq1Q7TMX5 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Shq1Q7TMX5 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Shq1Q7TMX5 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Shq1Q7TMX5 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Shq1Q7TMX5 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Shq1Q7TMX5 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Shq1Q7TMX5 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Shq1Q7TMX5 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Shq1Q7TMX5 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Shq1Q7TMX5 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Shq1Q7TMX5 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Shq1Q7TMX5 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Shq1Q7TMX5 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Shq1Q7TMX5 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Shq1Q7TMX5 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Shq1Q7TMX5 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Shq1Q7TMX5 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Shq1Q7TMX5 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Shq1Q7TMX5 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Shq1Q7TMX5 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Shq1Q7TMX5 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Shq1Q7TMX5 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Shq1Q7TMX5 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Shq1Q7TMX5 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Shq1Q7TMX5 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Shq1Q7TMX5 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Shq1Q7TMX5 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Shq1Q7TMX5 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Shq1Q7TMX5 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Shq1Q7TMX5 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Shq1Q7TMX5 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Shq1Q7TMX5 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Shq1Q7TMX5 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Shq1Q7TMX5 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Shq1Q7TMX5 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Shq1Q7TMX5 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Shq1Q7TMX5 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Shq1Q7TMX5 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Shq1Q7TMX5 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Shq1Q7TMX5 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Shq1Q7TMX5 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Shq1Q7TMX5 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Shq1Q7TMX5 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Shq1Q7TMX5 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Shq1Q7TMX5 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Shq1Q7TMX5 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Shq1Q7TMX5 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Shq1Q7TMX5 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Shq1Q7TMX5 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Shq1Q7TMX5 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Shq1Q7TMX5 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Shq1Q7TMX5 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Shq1Q7TMX5 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Shq1Q7TMX5 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Shq1Q7TMX5 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Shq1Q7TMX5 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Shq1Q7TMX5 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Shq1Q7TMX5 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Shq1Q7TMX5 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Shq1Q7TMX5 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Shq1Q7TMX5 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Shq1Q7TMX5 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Shq1Q7TMX5 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Shq1Q7TMX5 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Shq1Q7TMX5 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Shq1Q7TMX5 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Shq1Q7TMX5 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Shq1Q7TMX5 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Shq1Q7TMX5 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms