Protein–RNA interactions for Protein: Q76KJ5

Cd3eap, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA34, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd3eapQ76KJ5 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd3eapQ76KJ5 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd3eapQ76KJ5 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd3eapQ76KJ5 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd3eapQ76KJ5 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd3eapQ76KJ5 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cd3eapQ76KJ5 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cd3eapQ76KJ5 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cd3eapQ76KJ5 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cd3eapQ76KJ5 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cd3eapQ76KJ5 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cd3eapQ76KJ5 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cd3eapQ76KJ5 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cd3eapQ76KJ5 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cd3eapQ76KJ5 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cd3eapQ76KJ5 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Cd3eapQ76KJ5 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Cd3eapQ76KJ5 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cd3eapQ76KJ5 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cd3eapQ76KJ5 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cd3eapQ76KJ5 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cd3eapQ76KJ5 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cd3eapQ76KJ5 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cd3eapQ76KJ5 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cd3eapQ76KJ5 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cd3eapQ76KJ5 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cd3eapQ76KJ5 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cd3eapQ76KJ5 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cd3eapQ76KJ5 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cd3eapQ76KJ5 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cd3eapQ76KJ5 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cd3eapQ76KJ5 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cd3eapQ76KJ5 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cd3eapQ76KJ5 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cd3eapQ76KJ5 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cd3eapQ76KJ5 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Cd3eapQ76KJ5 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cd3eapQ76KJ5 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cd3eapQ76KJ5 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cd3eapQ76KJ5 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cd3eapQ76KJ5 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Cd3eapQ76KJ5 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Cd3eapQ76KJ5 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cd3eapQ76KJ5 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cd3eapQ76KJ5 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cd3eapQ76KJ5 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Cd3eapQ76KJ5 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cd3eapQ76KJ5 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cd3eapQ76KJ5 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cd3eapQ76KJ5 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cd3eapQ76KJ5 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cd3eapQ76KJ5 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cd3eapQ76KJ5 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cd3eapQ76KJ5 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cd3eapQ76KJ5 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cd3eapQ76KJ5 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cd3eapQ76KJ5 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cd3eapQ76KJ5 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cd3eapQ76KJ5 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cd3eapQ76KJ5 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cd3eapQ76KJ5 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cd3eapQ76KJ5 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cd3eapQ76KJ5 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cd3eapQ76KJ5 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cd3eapQ76KJ5 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cd3eapQ76KJ5 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cd3eapQ76KJ5 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd3eapQ76KJ5 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd3eapQ76KJ5 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd3eapQ76KJ5 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd3eapQ76KJ5 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd3eapQ76KJ5 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd3eapQ76KJ5 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd3eapQ76KJ5 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd3eapQ76KJ5 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd3eapQ76KJ5 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd3eapQ76KJ5 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd3eapQ76KJ5 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd3eapQ76KJ5 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd3eapQ76KJ5 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd3eapQ76KJ5 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd3eapQ76KJ5 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd3eapQ76KJ5 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd3eapQ76KJ5 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd3eapQ76KJ5 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd3eapQ76KJ5 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd3eapQ76KJ5 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd3eapQ76KJ5 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd3eapQ76KJ5 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd3eapQ76KJ5 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd3eapQ76KJ5 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd3eapQ76KJ5 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd3eapQ76KJ5 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd3eapQ76KJ5 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd3eapQ76KJ5 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd3eapQ76KJ5 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd3eapQ76KJ5 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd3eapQ76KJ5 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd3eapQ76KJ5 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd3eapQ76KJ5 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms