Protein–RNA interactions for Protein: Q715T0

Nme8, Thioredoxin domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme8Q715T0 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nme8Q715T0 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nme8Q715T0 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nme8Q715T0 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nme8Q715T0 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nme8Q715T0 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nme8Q715T0 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nme8Q715T0 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Nme8Q715T0 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nme8Q715T0 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nme8Q715T0 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nme8Q715T0 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nme8Q715T0 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Nme8Q715T0 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nme8Q715T0 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Nme8Q715T0 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Nme8Q715T0 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Nme8Q715T0 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nme8Q715T0 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nme8Q715T0 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nme8Q715T0 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Nme8Q715T0 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nme8Q715T0 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nme8Q715T0 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nme8Q715T0 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nme8Q715T0 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nme8Q715T0 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nme8Q715T0 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Nme8Q715T0 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Nme8Q715T0 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nme8Q715T0 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nme8Q715T0 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nme8Q715T0 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nme8Q715T0 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Nme8Q715T0 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nme8Q715T0 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Nme8Q715T0 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Nme8Q715T0 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nme8Q715T0 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nme8Q715T0 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Nme8Q715T0 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nme8Q715T0 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nme8Q715T0 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nme8Q715T0 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nme8Q715T0 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nme8Q715T0 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nme8Q715T0 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nme8Q715T0 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Nme8Q715T0 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nme8Q715T0 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nme8Q715T0 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Nme8Q715T0 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Nme8Q715T0 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nme8Q715T0 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nme8Q715T0 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nme8Q715T0 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nme8Q715T0 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nme8Q715T0 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nme8Q715T0 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nme8Q715T0 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nme8Q715T0 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nme8Q715T0 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nme8Q715T0 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nme8Q715T0 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nme8Q715T0 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nme8Q715T0 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nme8Q715T0 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nme8Q715T0 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Nme8Q715T0 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Nme8Q715T0 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nme8Q715T0 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nme8Q715T0 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nme8Q715T0 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nme8Q715T0 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nme8Q715T0 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nme8Q715T0 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nme8Q715T0 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nme8Q715T0 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nme8Q715T0 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nme8Q715T0 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nme8Q715T0 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nme8Q715T0 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nme8Q715T0 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nme8Q715T0 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Nme8Q715T0 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Nme8Q715T0 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Nme8Q715T0 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nme8Q715T0 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nme8Q715T0 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nme8Q715T0 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nme8Q715T0 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nme8Q715T0 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nme8Q715T0 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nme8Q715T0 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nme8Q715T0 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nme8Q715T0 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nme8Q715T0 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nme8Q715T0 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nme8Q715T0 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nme8Q715T0 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms