Protein–RNA interactions for Protein: Q70IV5

Synm, Synemin, mousemouse

Predictions only

Length 1,561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynmQ70IV5 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SynmQ70IV5 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SynmQ70IV5 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SynmQ70IV5 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
SynmQ70IV5 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SynmQ70IV5 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SynmQ70IV5 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SynmQ70IV5 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SynmQ70IV5 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SynmQ70IV5 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SynmQ70IV5 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SynmQ70IV5 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
SynmQ70IV5 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SynmQ70IV5 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SynmQ70IV5 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SynmQ70IV5 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SynmQ70IV5 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
SynmQ70IV5 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SynmQ70IV5 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SynmQ70IV5 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SynmQ70IV5 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SynmQ70IV5 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SynmQ70IV5 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
SynmQ70IV5 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
SynmQ70IV5 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SynmQ70IV5 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SynmQ70IV5 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SynmQ70IV5 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SynmQ70IV5 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SynmQ70IV5 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SynmQ70IV5 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SynmQ70IV5 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SynmQ70IV5 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SynmQ70IV5 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SynmQ70IV5 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SynmQ70IV5 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SynmQ70IV5 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SynmQ70IV5 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
SynmQ70IV5 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SynmQ70IV5 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SynmQ70IV5 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SynmQ70IV5 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SynmQ70IV5 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SynmQ70IV5 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SynmQ70IV5 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SynmQ70IV5 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SynmQ70IV5 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SynmQ70IV5 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SynmQ70IV5 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SynmQ70IV5 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SynmQ70IV5 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SynmQ70IV5 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
SynmQ70IV5 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SynmQ70IV5 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SynmQ70IV5 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SynmQ70IV5 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SynmQ70IV5 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SynmQ70IV5 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SynmQ70IV5 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SynmQ70IV5 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SynmQ70IV5 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SynmQ70IV5 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SynmQ70IV5 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SynmQ70IV5 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SynmQ70IV5 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SynmQ70IV5 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SynmQ70IV5 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SynmQ70IV5 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SynmQ70IV5 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SynmQ70IV5 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SynmQ70IV5 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SynmQ70IV5 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SynmQ70IV5 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SynmQ70IV5 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SynmQ70IV5 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SynmQ70IV5 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SynmQ70IV5 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SynmQ70IV5 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SynmQ70IV5 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SynmQ70IV5 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SynmQ70IV5 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SynmQ70IV5 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SynmQ70IV5 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
SynmQ70IV5 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SynmQ70IV5 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SynmQ70IV5 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SynmQ70IV5 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SynmQ70IV5 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SynmQ70IV5 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
SynmQ70IV5 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SynmQ70IV5 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SynmQ70IV5 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
SynmQ70IV5 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
SynmQ70IV5 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SynmQ70IV5 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
SynmQ70IV5 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SynmQ70IV5 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SynmQ70IV5 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SynmQ70IV5 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SynmQ70IV5 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms