Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWQ0

Syne2, Nesprin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 6,874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne2Q6ZWQ0 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Syne2Q6ZWQ0 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Syne2Q6ZWQ0 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Syne2Q6ZWQ0 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Syne2Q6ZWQ0 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Syne2Q6ZWQ0 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Syne2Q6ZWQ0 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Syne2Q6ZWQ0 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Syne2Q6ZWQ0 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Syne2Q6ZWQ0 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Syne2Q6ZWQ0 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Syne2Q6ZWQ0 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Syne2Q6ZWQ0 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Syne2Q6ZWQ0 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Syne2Q6ZWQ0 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Syne2Q6ZWQ0 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Syne2Q6ZWQ0 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Syne2Q6ZWQ0 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Syne2Q6ZWQ0 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Syne2Q6ZWQ0 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Syne2Q6ZWQ0 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Syne2Q6ZWQ0 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Syne2Q6ZWQ0 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Syne2Q6ZWQ0 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Syne2Q6ZWQ0 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Syne2Q6ZWQ0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Syne2Q6ZWQ0 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Syne2Q6ZWQ0 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Syne2Q6ZWQ0 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Syne2Q6ZWQ0 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Syne2Q6ZWQ0 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Syne2Q6ZWQ0 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Syne2Q6ZWQ0 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Syne2Q6ZWQ0 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Syne2Q6ZWQ0 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Syne2Q6ZWQ0 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Syne2Q6ZWQ0 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Syne2Q6ZWQ0 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Syne2Q6ZWQ0 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Syne2Q6ZWQ0 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Syne2Q6ZWQ0 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Syne2Q6ZWQ0 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Syne2Q6ZWQ0 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Syne2Q6ZWQ0 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Syne2Q6ZWQ0 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Syne2Q6ZWQ0 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Syne2Q6ZWQ0 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Syne2Q6ZWQ0 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Syne2Q6ZWQ0 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Syne2Q6ZWQ0 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Syne2Q6ZWQ0 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Syne2Q6ZWQ0 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Syne2Q6ZWQ0 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Syne2Q6ZWQ0 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Syne2Q6ZWQ0 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Syne2Q6ZWQ0 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Syne2Q6ZWQ0 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Syne2Q6ZWQ0 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Syne2Q6ZWQ0 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Syne2Q6ZWQ0 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Syne2Q6ZWQ0 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Syne2Q6ZWQ0 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Syne2Q6ZWQ0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Syne2Q6ZWQ0 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Syne2Q6ZWQ0 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Syne2Q6ZWQ0 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Syne2Q6ZWQ0 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Syne2Q6ZWQ0 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Syne2Q6ZWQ0 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Syne2Q6ZWQ0 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Syne2Q6ZWQ0 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Syne2Q6ZWQ0 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Syne2Q6ZWQ0 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Syne2Q6ZWQ0 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Syne2Q6ZWQ0 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Syne2Q6ZWQ0 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Syne2Q6ZWQ0 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Syne2Q6ZWQ0 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Syne2Q6ZWQ0 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Syne2Q6ZWQ0 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Syne2Q6ZWQ0 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Syne2Q6ZWQ0 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Syne2Q6ZWQ0 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Syne2Q6ZWQ0 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Syne2Q6ZWQ0 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Syne2Q6ZWQ0 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Syne2Q6ZWQ0 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Syne2Q6ZWQ0 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Syne2Q6ZWQ0 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Syne2Q6ZWQ0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Syne2Q6ZWQ0 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Syne2Q6ZWQ0 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Syne2Q6ZWQ0 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Syne2Q6ZWQ0 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Syne2Q6ZWQ0 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Syne2Q6ZWQ0 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Syne2Q6ZWQ0 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Syne2Q6ZWQ0 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Syne2Q6ZWQ0 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Syne2Q6ZWQ0 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms